军长的官更大。
首先，根据我国《国家公务员法》 第十六条之规定：公务员职务分为领导职务和非领导职务。领导职务层次分为：国家级正职、国家级副职、省部级正职、省部级副职、厅局级正职、厅局级副职、县处级正职、县处级副职、乡科级正职、乡科级副职。
其次，省公安厅厅长的公务员级别是厅局级正职（正厅级）。而部队里的军长是正军职（军衔通常为少将或中将），其对应的行政级别是省部级副职（副部级）。这个级别比厅局级正职（正厅级）正好高出一级。
补充中国职务与级别的对应关系是：
（一）国务院总理：一级；
（二）国务院副总理，国务委员：二至三级；
（三）部级正职，省级正职：三至四级；
（四）部级副职，省级副职：四至五级；
（五）司级正职，厅级正职，巡视员：五至七级；
（六）司级副职，厅级副职，助理巡视员：六至八级；
（七）处级正职，县级正职，调研员：七至十级；
（八）处级副职，县级副职，助理调研员：八至十一级；
（九）科级正职，乡级正职，主任科员：九至十二级；
（十）科级副职，乡级副职，副主任科员：九至十三级；
（十一）科员：九至十四级；
（十二）办事员：十至十五级。
国家级正职：
包括中央军委主席、国家主席、全国人大常委会委员长、国务院总理、全国政协主席、国家副主席、国务院第一副总理、中央精神文明建设委员会主任、中央纪委书记、中央政法委书记等国家头号人物，即中共中央政治局常委。
国家级副职：
包括中央军委副主席、全国政协副主席、全国人大常委会副委员长、中宣部部长、中组部部长、国务院副总理、国务委员、各直辖市市委书记（即中共中央政治局非常委委员），最高人民检察院院长、最高人民法院院长等。
省部级正职：
包括各个省级行政区的省委书记、省长、省政协主席、省人大常委会主任等、特别行政区行政长官、新疆生产建设兵团政委和司令员等。国务院各部委正职干部（如教育部部长、国家发改委主任）。各省、自治区、直辖市及新疆生产建设兵团政府正职干部（如江苏省省长、天津市市长、新疆兵团司令员）。
省部级副职：
包括各个省级行政区的省委副书记、副省长、省政协副主席、省人大常委会副主席、省人大常委、直辖市市委副书记以及国家各部副部长等。国务院各部委副职干部（如公安部副部长、国家体育总局副局长）。国务院部委管理的国家局正职干部（如国家文物总局局长）。各省、自治区、直辖市、新疆生产建设兵团政府副职干部（如吉林省副省长、重庆市副市长、新疆建设兵团副司令员）。各副省级市政府正职干部（如南京市市长）。各直辖市下属副省级新区正职干部（如浦东新区区委书记）。