区别：最主要的区别是操作证只能对挖掘机进行操作，而资格证是经过考核合格后所获得。
具体区别看两种证件的相关介绍：
(1)挖掘机操作证：2012年起，工程建设机械已经不再列为特种设备目录（塔吊、施工升降机、行车等少数机种除外）。目前挖掘机、装载机等大部分机种的建设机械已经不属于特种设备，不涉及特种作业，因此也不再是特种作业证书。质监部门负责生产制造领域的监管职能，不再办理施工现场环节的工程建设机械类操作证书。
(2)挖掘机资格证：即挖掘机资格证书，是表明劳动者具有从事挖掘机操作所必备的学识和技能的证明。它是劳动者求职、任职、开业的资格凭证，是用人单位招聘、录用劳动者的主要依据，也是境外就业、对外劳务合作人员办理技能水平公证的有效证件。
拓展资料：
挖掘机证书种类：
（1）培训合格证书和施工作业操作证书
学员通过专业培训后具备岗位能力的重要证明，是工伤事故及安全事故中证明自身接受过系统培训具备基本岗位能力的重要辅证；同时证明自己接受了专业培训并具备了基本岗位能力，符合建设机械国家及行业标准、产品标准和施工规程对操作者的基本入职要求。
（2）属于特种设备和特种作业的岗位机种，学员应在获取岗位能力培训合格证书和施工作业操作证书后，自觉接受政府的特种设备和特种作业安全培训，获得特种作业资格证书。
（3）技能等级和职业资格证书：相当于职称证，是由人事劳动部门发放的一种水平证书；目前相关土方机械操作类专业的等级证书可由学员所在地劳动部门职业技能鉴定站获得。
以上任何一种证书，学员均应通过正规渠道报名，系统接受培训后获取，不要采用花钱买证等愚蠢行为。
发生事故后，事故调查机构会追溯学员培训记录档案，社会保险机构也将学员能力证书和上岗资格作为理赔要件。对于培训合格证书和施工作业操作证书，学员发生事故后专委会将根据有关程序向有关机构出具学员培训记录和档案的真实情况，作为事故处理和保险理赔的第三方证明材料。因此学员档案的生成、记录的真实性、档案长期保管显得特别重要。考取职业资格与技能等级证书和特种作业资格证书的学员培训档案分别由劳动部门和安监部门存放，必要时，学员和培训机构也应保存一份。
（资料来源：百度百科：挖掘机操作证）