新农合门诊可以按一定比例进行报销，不过要求新农合的参保人员在定点医院看门诊，报销范围包括药费、检查费、化验费等等。新农合门诊的报销比例如下：
1、村卫生室和村中心卫生室门诊报销60%；
2、镇卫生院就诊报销的比例为40%；
3、二级医院门诊报销的比例是30%；
4、镇级合作医疗门诊每年限额5000元。
农村合作医疗报销范围是：
1、门诊补偿：
（1）村卫生室及村中心卫生室就诊报销60%，每次就诊处方药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元。
（2）镇卫生院就诊报销40%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元。
（3）二级医院就诊报销30%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
（4）三级医院就诊报销20%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
（5）中药发票附上处方每贴限额1元。
（6）镇级合作医疗门诊补偿年限额5000元。
2、住院补偿
（1）报销范围：
a、药费：辅助检查：心脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等各项检查费限额200元;手术费(参照国家标准，超过1000元的按1000元报销)。
b、60周岁以上老人在镇卫生院住院，治疗费和护理费每天补偿10元，限额200元。
（2）报销比例：镇卫生院报销60%;二级医院报销40%;三级医院报销30%。
3、大病补偿
镇风险基金补偿：凡参加合作医疗的住院病人一次性或全年累计应报医疗费超过5000元以上分段补偿，即5001-10000元补偿65%，10001-18000元补偿70%。
镇级合作医疗住院及尿毒症门诊血透、肿瘤门诊放疗和化疗补偿年限额1.1万元。
新农合报销分为门诊报销和住院报销，以及涉及特殊病种报销材料也有所不同：
1、门诊报销携带资料：
门诊发票、合作医疗证历本（或病历）；
2、住院报销携带资料：
住院发票、合作医疗证历本（或病历）、费用明细清单、出院小结、其它有关证明；
3、门诊特殊病报销携带资料：
门诊发票、特殊病种合作医疗证历本；
4、办理特殊病种携带资料：
特殊病种门诊治疗建议书、合作医疗证历本、病历、有关化验报告单、照片二张。
新农合报销流程：
1、门诊报销流程
（1）参保患者持合作医疗证到定点医院就医；
（2）凭检查、治疗处方到门诊收费处划价收费；
（3）自行支付门诊医疗费用；
（4）在相关科室进行检查。门诊药房取药；
（5）持合作医疗证、身份证、户口本、发票就门诊一楼；
（6）最后到新农合窗口审核、报销并领取报销款。
2、住院报销流程
（1）参保患者持合作医疗证到定点医院就医
（2）由医生开具住院证明，主治医生核对病人合作医疗证，身份证、户口本原件及复印件并签字；
（3）到新农合窗口办理住院登记；
（4）自行支付住院医疗费用；
（5）持出院证明、住院发票、合作医疗证、患者身份证、户口本、领款人身份证到医院一楼；
（6）到新农合窗口审核、报销并领取报销款。