数千年来一直沿用至今的科举制最终被废止，究其根源，是因为八股选拔人才的方法与朝堂选拔人才的标准不符，与国际社会发展趋势和新时期的需求相适应。19世纪末，随着数次战争的失败和巨额的割地赔偿，清朝的衰亡在某种意义上已得到了承认。同时，清朝还进行了一系列的“自救”活动，包括“洋务”、“西学”的深入发展，使清廷自身认识到了科举制度的缺陷。
因此，1888年，清朝开始实行科举制，设置“数理”，第一次将理科列入科考，以求取贤能；1889年，清廷设立了专门的经学专业，以甄别经学上的才子，而康有为等改革派则提倡从八股制中改成了《策》，试图从根本上扭转科举学的僵硬状况，然而这种做法过于偏激，受到了保守党和部分学者的反对，很快就被慈禧皇帝废止。
1901年，清廷认识到如果再不进行一次比较全面的变革和变革是无法实现的，于是就实行了“清末新政”。在各国的强烈反对下，清朝政府发布了《奏定学堂章程》，其中提到：“八股选生，以考科为主。”然而此时的科举还未被废止，读书十多年的士子，由于各种理由，依然偏爱科考，忽视了策论。
为此，清王朝应张之洞等人的提议，积极推行新型学校，重点是教育和选拔人才、用才相结合的新型学校。在这种情况下，清朝颁布了《1906》，取消了科举，颁布了新的课本，建立了专门的学校，取消了一千多年的科举制度。
无论何种选举体制，都要受到社会体制的约束，包括科举考试。因为科举制以选拔官员为主，而非以士大夫等专业人员为主，因此，其考核的范围也就随之确定；与此同时，由于生产力发展程度的制约，又难以在科举中增设数学、物理、农学甚至工商管理学这些还没有建立起来的专业。清末之所以废除科举，并非因为它自身的弊端，而是因为它的社会体制。诚然，以实用为导向的科考，使士大夫们断章取义地对待文化遗产，钻研甚至强记八股，以求得名，以求得利，这在当时的意识形态、文化、科技上，都有极其不利的作用。