办理烟草许可证的流程是： 1、申请人直接到当地县级烟草专卖局办证大厅申请，具备条件的地方也可以网上申请； 2、若申请材料齐全、符合法定形式，县级烟草专卖局应当受理，并将加盖专用印章的《受理行政许可通知书》送达申请人； 3、烟草专卖局受理后会进行核查； 4、审核审批。
《 行政许可法 》第十二条 下列事项可以设定行政许可： （一）直接涉及国家安全、公共安全、经济宏观调控、生态环境保护以及直接关系人身健康、生命财产安全等特定活动，需要按照法定条件予以批准的事项； （二）有限自然资源开发利用、公共资源配置以及直接关系公共利益的特定行业的市场准入等，需要赋予特定权利的事项； （三）提供公众服务并且直接关系公共利益的职业、行业，需要确定具备特殊信誉、特殊条件或者特殊技能等资格、资质的事项； （四）直接关系公共安全、人身健康、生命财产安全的重要设备、设施、产品、物品，需要按照技术标准、技术规范，通过检验、检测、检疫等方式进行审定的事项。