两个专业方向差异极大。自动化属于信息学科，是弱电方向；电气工程及其自动化则是强电方向。
另外，自动化、电气工程都是一级学科，其内部各个二级学科之间的差异也很大。如要具体了解这两个学科方向，可以看看它们各自的二级学科：
1.自动化（控制科学与工程）：控制理论与控制工程，模式识别与智能系统，检测技术与自动化装置排名，系统工程，导航、制导与控制。
2.电气工程及其自动化：电机与电器，电力系统及其自动化，高电压与绝缘技术，电力电子与电力传动，电工理论与新技术。
至于比较推荐的工科类专业，推荐电子科学与技术，无论是科学研究还是就业都非常好
区别就是，电气工程及其自动化偏重电气方面的控制，主要研究运动控制，电机学和电机调速是主要课程。电气工程与自动化涵盖的广一点，不但研究电气控制，运动控制，还研究过程控制，像化工行业的流量，压力等自动化控制。
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