分子信标的结构

如题所述

分子信标的设计一般包括三个部分:
(1)环状区:一般为长度15~30碱基的序列,能与目标分子特异结合;
(2)信标茎干区:通常为长度5~8 个碱基的互补序列,茎干区与杂交后环状区-
目标分子的双链结构之间的热力学平衡关系,使分子信标的杂交特异性明显高于常规的
线状探针;
(3)荧光基团和淬灭基团,荧光基团一般联接在信标分子的5 端;淬灭基团联接
在3’端。图1 为经典的分子信标结构,其中1—氨基萘—8—羧酸(EDANS)为荧光素,
二甲氨基偶氮苯甲酰(DABSYL)为淬灭剂。分子信标中常用4—(4’— 二甲基氨基偶氮
苯基)苯甲酸(DABCYL)作为淬灭基团,德克萨斯红(TexasRed)、荧光素(Fluoresein)等作
为荧光基团。

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