生物医学工程的主要任务是应用最先进的理工科理论与方法来研究人的生命现象与规律，是理、工、医高度交叉的新兴学科，研究领域广泛，是21世纪最具有潜在发展优势的领先科技之一，世界上几乎所有的一流大学都开设有生物医学工程专业。生物医学工程专业与生命、信息、材料和能源等高新技术均有紧密关系，已成为生命科学的重要支柱；生物医学工程产业为医学提供现代医疗装备，对提高人民医疗卫生保健水平具有举足轻重的地位。伴随着生物医学工程学科和中国医疗器械产业的发展，生物医学工程专业越来越受到重视。
北航生物医学工程专业隶属于生物与医学工程学院，是具有学士、硕士及博士授予权的一级学科专业。专业定位于工程科学与生命科学的相互交叉、渗透与融合，并兼有航空航天特色。主要通过数理化、计算机和外语等公共基础课程，电子信息、模拟数字电子技术、图象及信号处理、机械设计、解剖生理学等专业技术基础知识的学习，结合科学实验研究能力与工程设计能力的训练，了解生物医学工程学科的最新发展动态，熟悉生物医学工程各方向的科学研究、技术开发、过程设计及生产管理内容。
生物医学工程专业不但要求学生具备坚实的数理工程基础，而且掌握生物力学建模与仿真、生物医学信号与图像处理、生物材料制备与测试、生物医学仪器设计、人机系统设计与评价等方面的专业知识，培养基础扎实的生物医学工程方面的专门人才。
生物医学工程专业的学生毕业后除了可以在相关领域继续深造以外，还可以在医疗器械、人工器官、生物材料、医疗器械生产质量控制、生物电子、生物系统仿真、生物医学信息与仪器、航空航天医学工程等生物医学工程领域的相关部门从事科学研究、产品开发、教学、管理及贸易等方面的工作。 北京航空航天大学生物与医学工程学院生物科学与技术系，是在成立于2001年的原生物工程系基础上建立起来的。生物科学与技术系拥有一个本科专业——生物工程专业。专业于2002年招收第一届本科生，2008年被评为北京市本科专业特色专业。
生物工程专业坚持北京航空航天大学“厚基础、重实践、高素质、善创新、国际化”的人才培养方针，充分利用北航雄厚的数理化教学资源，培养学生具有坚实的数理化的基础，在此基础上培养学生扎实的生物科学基础理论、基本知识和基本技能，掌握现代生物技术领域的基本工程技术的基本原理和基本技能，充分体现生命科学与工程科学的相互渗透与融合。生物工程专业主要面向新医药产业及相关空间生命科学，侧重培养掌握生物技术基础理论和技能以及现代生物工程基本原理和实践技能的高素质人才。
主要研究方向有：空间生命科学、血细胞生物学、生物质资源利用、天然产物的分离及药理毒理学、环境生物技术、细胞与组织工程等。建设的研究与实验技术平台包括：分子细胞生物学实验室、生物化学与分子生物学教学实验室、微生物学实验室、力-细胞生物学实验室（空间生命科学）、血液与细胞生物学实验室、生物医药与健康实验室、环境生物学与生命保障技术实验室等。承担国家自然科学基金、国家863以及教育部、国防工委和北京市等省部级项目等多项。生物科学与技术系力争建成一流的具有航空航天特色的生物科学与技术科学研究及高级人才培养基地。
