首先确定自己所在的地区，上当地的科技部门网站或咨询相应政府人员，是否有“科技型中小企业创新基金”项目，一般情况下是省市级科技部门发布通知，如北京市科委。
其次，根据当地的政策通知文件，查看企业是否满足“科技型中小企业创新基金”的条件，如果满足，根据它的通知要求，准备相应的材料即可。材料一定要提前准备，否则等通知发布后再准备可能就晚了。
最后，确定申报时间，提交材料即可。每年创新基金都会有一批，你看当地的申报时间是什么时间。
注意：一般是省市级通过一批，并将其中优秀的部分项目推荐至国家。所以优秀的项目有可能获得两个部门的补助呢。就算没有推荐至国家，获得省市级也可。
另，你如果是初次申报创新基金网站，可以看官网
http://www.innofund.gov.cn/。供你学习参考吧。