首先明确一个问题，劳动法并没有关于旷工多少天单位可以解除劳动合同的规定。在HR业界普遍使用的是连续旷工三天当员工自离，或视为严重违反规章制度，给予解除劳动合同，不支付经济补偿金。
根据1982年公布的《企业职工奖惩条例》第十八条规定，职工无正当理由经常旷工，经批评教育无效，连续旷工时间超过15天，或者一年以内累计旷工时间超过30天的，企业有权予以除名。但此条例已于2008年废止（中华人民共和国国务院令第516号：
http://www.gov.cn/gongbao/content/2008/content_901287.htm），被《劳动法》和《劳动合同法》所代替。在这两个法律里，并没有明确规定员工旷工多少天企业可以解除劳动合同。
根据《劳动合同法》第三十九条第二项规定，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同，根据《劳动合同法》第四十六条规定，用人单位需向劳动者支付经济补偿金的情形，不含依据第三十九条规定解除劳动合同的情形，即，用人单位依据第三十九条与劳动者解除劳动合同的，不必支付经济补偿金。
由于法律只规定了劳动者“严重违反用人单位规章制度”的，单位可以解除劳动合同，却没有规定劳动者旷工多少天，单位可以解除劳动合同。所以，在现实操作中，单位往往把无故旷工一天定义为书面警告一次，劳动者连续获得三次书面警告，或者在某个时段内（比如一个自然年度内）获得三次书面警告的，定义为“严重违反用人单位规章制度”，单位有权与劳动者解除劳动合同，而不支付经济补偿金。
这里就有两个问题需要强调：
1、单位直接用旷工三天来解除劳动合同，是不合法的，但是，如果单位制定的规章制度里，有类似我上面论述的“三次书面警告”的规定，单位把旷工三天定义为“严重违反用人单位规章制度”而与劳动者解除劳动合同的（不支付经济补偿金），这就是合法的了。
2、用人单位的规章制度，必须是合法的。规章制度合法，应当符合三要素：实体合法、程序合法、公示（这里不展开说了）。
综合上述两点，结论是：如果用人单位没有把劳动者旷工三天定义为“严重违反”，或者用人单位规章制度不合法（不能同时符合三要素），那么，单位以旷工三天为由与劳动者解除劳动合同而不支付经济补偿金，就是不合法的。