因为明朝有三位皇帝并未葬在这处皇陵之中，按照在位时间顺序分别是朱元璋、朱允炆以及朱祁钰。
朱元璋：葬于南京明孝陵
众所周知，朱元璋乃是明王朝的开国皇帝。他在争夺天下时最先收复的是江南地区，是以他将称帝地点定在了南京。不仅如此，朱元璋在称帝之后还将南京设为了国都。南京竟是国都，且朱元璋在位期间也未曾迁都过，那么他的陵墓自然也就就近建在了南京。朱元璋的明孝陵具体位于南京紫金山南麓，于1381年开始修建，后于1405年建造完成。在明孝陵开建的第二年身为朱元璋原配皇后的马皇后便因病逝世，随后被葬入该陵墓。而后在1398年的时候，积劳而逝的朱元璋也被葬入明孝陵。
朱允炆：不曾建有陵墓
朱元璋驾崩之后，身为其孙子的朱允炆接任为明朝皇帝。朱允炆的在位时间是1398年6月至1402年7月，前后仅在位四年左右时间。而在这短暂的在位时间里，朱允炆的精力主要是放在平定燕王叛乱这一事情上，所以并不曾下令为自己修建陵墓。而待燕王于1402年顺利攻进南京之后，朱允炆便自此不知所踪。而燕王朱棣在登基之后也未曾下令为朱允炆补建陵墓，是以当了四载皇帝的朱允炆成了明朝十六帝中唯一一个没有陵墓的。
朱祁钰：死后被剥夺葬入皇陵的资格
朱祁钰是明朝的第七任皇帝，前后共在位七年。朱祁钰的登基时间是1449年，这一年明朝经历了国君被俘这一重大变故。被俘的明朝国君是朱祁钰的兄长，即明英宗朱祁镇。也正是因为这一变故的发生，朱祁钰才会急急忙忙地被拥立为帝。而就在他在位的第七年，部分朝臣因见他病重，外加他无子可承皇位，于是便合起伙来将返明之后一直被软禁的明英宗给重新复立为了皇帝。而明英宗在重登皇位之后为了报复，他在朱祁钰去世之后直接捣毁了朱祁钰先前修建于明十三陵内的陵墓，然后只许朱祁钰以王爷的身份入葬至景泰陵。
明十三陵是坐落在北京昌平的一片皇陵，皇陵三面环山，陵前有一条小河曲折蜿蜒，整个皇陵占据了昌平最好的风水，但是你会有一件事情感到奇怪，明朝一共有16个皇帝，而北京这里只有明十三陵，其他三个皇帝都去哪里了，我们来看看明十三陵到底埋葬着那些皇帝。从朱元璋建立大明朝到崇祯亡国，明朝享国276年，而这其中一共传了十六个皇帝，其中分别是明太祖朱元璋、明惠帝朱允炆、明成祖朱棣、明仁宗朱高炽、明宣宗朱瞻基、明英宗朱祁镇、明代宗朱祁钰、明宪宗朱见深、明孝宗朱佑樘、明武宗朱厚照、明世宗朱厚熜、明穆宗朱载垕、明神宗朱翊钧、明光宗朱常洛、明熹宗朱由校、明思宗朱由检，其中除了明太祖、明惠帝、明代宗之外，
其他十三个皇帝尽数葬到了明十三陵，刚好十三个皇帝。而其他三位就有的说了，首先就是明太祖朱元璋，朱元璋那可是打天下的人，但是朱元璋最早是在南京做的京师，所以朱元璋的陵墓就葬在了南京市的玄武区，也就是“明孝陵”。话说这明孝陵可是朱元璋从洪武十四年一直建到了永乐三年，
先后调用军工10万多人，历时25年之久，承唐宋帝陵“依山为陵”旧制，又创方坟为圜丘新制。将人文与自然和谐统一，达到天人合一的完美高度。明惠帝就是朱元璋的孙子朱允炆，话说朱允炆本来即位之后严惩宦官，改革了朱元璋的一些弊政，怎么看都是一位贤明的君主。但是由于朱允炆想要稳固皇权，
于是就削弱藩王导致了燕王朱棣以“清君侧”的名义造反。而姜还是老的辣，朱允炆根本斗不过朱棣，反而还在燕军进京之后，自己烧死在了南京皇宫，但是有人说朱允炆去做了和尚，但归根到底朱允炆还是没有个消息，所以朱允炆也没有葬在明十三陵。
朱元璋：葬于南京明孝陵
众所周知，朱元璋乃是明王朝的开国皇帝。他在争夺天下时最先收复的是江南地区，是以他将称帝地点定在了南京。不仅如此，朱元璋在称帝之后还将南京设为了国都。南京竟是国都，且朱元璋在位期间也未曾迁都过，那么他的陵墓自然也就就近建在了南京。朱元璋的明孝陵具体位于南京紫金山南麓，于1381年开始修建，后于1405年建造完成。在明孝陵开建的第二年身为朱元璋原配皇后的马皇后便因病逝世，随后被葬入该陵墓。而后在1398年的时候，积劳而逝的朱元璋也被葬入明孝陵。
朱允炆：不曾建有陵墓
朱元璋驾崩之后，身为其孙子的朱允炆接任为明朝皇帝。朱允炆的在位时间是1398年6月至1402年7月，前后仅在位四年左右时间。而在这短暂的在位时间里，朱允炆的精力主要是放在平定燕王叛乱这一事情上，所以并不曾下令为自己修建陵墓。而待燕王于1402年顺利攻进南京之后，朱允炆便自此不知所踪。而燕王朱棣在登基之后也未曾下令为朱允炆补建陵墓，是以当了四载皇帝的朱允炆成了明朝十六帝中唯一一个没有陵墓的。
朱祁钰：死后被剥夺葬入皇陵的资格
朱祁钰是明朝的第七任皇帝，前后共在位七年。朱祁钰的登基时间是1449年，这一年明朝经历了国君被俘这一重大变故。被俘的明朝国君是朱祁钰的兄长，即明英宗朱祁镇。也正是因为这一变故的发生，朱祁钰才会急急忙忙地被拥立为帝。而就在他在位的第七年，部分朝臣因见他病重，外加他无子可承皇位，于是便合起伙来将返明之后一直被软禁的明英宗给重新复立为了皇帝。而明英宗在重登皇位之后为了报复，他在朱祁钰去世之后直接捣毁了朱祁钰先前修建于明十三陵内的陵墓，然后只许朱祁钰以王爷的身份入葬至景泰陵。