一般把人体的腧穴分为十四经穴、奇穴、阿是穴三类。
（一）十四经穴
十四经穴简称“经穴”，即分布于十二经脉及任、督二脉上的腧穴。经穴具有主治本经病证的共同作用，因此分别归纳于十四经系统中，它们是腧穴的主要部分。现在多沿用清代医家李学川在《针灸逢源》一书中所记载的361个经穴，即手太阴肺经11穴，手少阴心经9穴，手厥阴心包经9穴，手阳明大肠经20穴，手太阳小肠经19穴，手少阳三焦经23穴，足太阴脾经21穴，足少阴肾经27穴，足厥阴肝经14穴，足阳明胃经45穴，足太阳膀胱经67穴，足少阳胆经44穴，督脉28穴，任脉24穴，合之361穴。因十二正经左右对称，故左右十二经穴共618穴，加任督二脉全身总共670穴。
（二）奇穴
奇穴是指既有一定的穴名，又有明确的位置，但尚未列入十四经系统的腧穴，又称“经外奇穴”。有的奇穴是单一的，如阑尾穴，有的奇穴是多个穴位，如八邪、八风等。奇穴的主治作用一般比较单纯，对某些病证具有特殊的治疗作用，如百劳治疗瘰疬，四缝治疗小儿疳疾等。奇穴有的位于十四经之外，如鹤顶、华佗夹脊等；有的位于十四经之中，但却不是该经的经穴，如治疗冠心病心绞痛的心平穴就位于手少阴心经上，但却不是心经的穴，有的奇穴本身就是经穴之一，如“胞门”实际就是足阳明胃经的“水道”穴，明代《针灸聚英》中提到的“四花”穴就是指两侧足太阳膀胱经的“胆俞”和“膈俞”穴。
（三）阿是穴
阿是穴又称压痛点、天应穴、不定穴等。这一类腧穴既无具体名称，又无固定位置，而是以压痛点或其他反应点作为针灸部位。阿是穴一般位于病变部位的附近，但有时也可出现在距病位较远的特殊部位。