区别是学区划分不一样。
龙岗学区户籍是指户籍所在地刚好在龙岗区某个学校的学区划分范围内，这样的户籍就是学区户籍。而本区户籍是指整个区的，并不限定为单个学校学区范围内的。深圳目前小一初一学位派位采取的是就近原则，学区户籍会比本区户籍更有优势。
需要注意的是，申请学区户口要求学生必须在该区内就读，否则无法申请成功。此外，申请人和父母的工作单位或社保缴纳地也必须在该区内。如果学生转学到其他区，需要重新办理户口迁移手续。
总之，申请深圳龙岗区学区户口需要提供相关材料并按照规定的程序办理，符合条件的申请人可以成功办理。
宝安、龙岗、龙华、光明、坪山更看重户籍
1、龙岗区实行按学区积分高低进行学位排队的制度。学区积分由基础分和加分两部分构成，满分为110分。“所在学区户籍，父母或法定监护人在学区有特殊住房（自建房、集资房、祖屋、集体宿舍、军产房、祖父母或外祖父母拥有学区合法产权房且产权份额大于50％）或者租房”类型，基础分为90分。
而“非深户籍，学区购房（父母或法定监护人有该学区合法产权），且产权份额大于50％”类型，基础分为80分，两者相差10分。
2、宝安区，在学位类型划分的基础上积分，划分为8个学位类型，按“先类别后积分”的原则，从第1类到第8类依次录取，同一类学生则按照积分从高到低录取，公办学校招生计划录满为止。
3、龙华区，根据申请学生户籍和住房情况，共划分为6类学位类型。根据“先类别后积分”的原则，按照学位类型1至6类依次录取，同一学位类型学生则按照积分从高到低录取，至学校招生计划录满为止。
4、光明新区义务教育阶段学位类型按照户籍和购房情况分为4类，第一类为学区户籍儿童，其中租住合法产权房，积分为1分/月；第三类为非深户籍儿童，学区购房（父母或监护人有该学区商品房，产权大于50％），其中住房积分为商品房（住宅或商住两用）1分/月。