熟菜真空包装后的除菌程序流程主要是选用微波杀菌的方法。
微波杀菌特性：
1、时间较短、速度更快
基本供热除菌是根据导热，
热对流或辐射源等方法将
发热量从食品表层传到内部。要做到除菌温度，通常需要长时间。微波杀菌是微波加热能与食品以及病菌等微生物菌种立即相互影响，
热电效应和非热电效应相互功效，做到迅速提温抑菌作用，解决时间大大缩短，各种各样原材料的抑菌作用一般在3-5分钟。
2、低温杀菌维持营养元素和传统式口味
微波杀菌是根据独特热和非热电效应除菌，与基本供热除菌较为，能在较为低的温度和较短的时间就能得到 需要的杀菌消毒实际效果。实践活动说明，一般除菌温度在75-80℃就能达到效果，除此之外，微波加热解决食品能保存大量的营养元素和色、香、味、形等口味，且有彭化实际效果。如基本供热解决的蔬菜水果保存的
维他命C是46-50%，而微波加热解决是60-90%，基本加温牛肝
维生素D维持为58%，而微波炉加热为84%。
3、节约资源
基本供热除菌通常在自然环境及机器设备上存有热损害，而微波加热是立即对食品开展功效解决，因此没有附加的能源耗损。除此之外，其电磁能到微波加热能的变换高效率在70-80%，相比而言，一般可省电30-50%。
4、表层和内部都另外开展
基本供热除菌是以原材料表层刚开始，随后根据导热传到内部，存有内外温度差。以便维持食品口味，减少解决时间，通常食品内部没有做到充足温度而影响除菌实际效果。因为微波加热具备透过功效，对食品开展总体解决时，表层和内部都另外遭受功效，因此 杀菌消毒匀称、完全。
5、有利于控制
微波加热食品除菌解决，机器设备能即开即用，没有基本供热除菌的热
惯性力，实际操作灵便便捷，微波加热
输出功率能从零到最大功率持续可调式、传输速率从零开始持续调节，有利于控制。
6、机器设备简易，加工工艺优秀
与基本杀菌消毒对比，微波杀菌机器设备，不需要加热炉，繁杂的管路系统，煤厂和车辆运输等，要是具有水、电基本标准就可以。
7、改进劳动者标准，节约占地
机器设备的工作中工作温度低、噪声小，巨大地改进了劳动者标准。全套微波设备的实际操作工作人员只需2-3人。普遍用以风干牛肉、
猪肉脯、鱼肉、酱囟肉、鹅肉、
鸡脯肉等产品的热化、干躁和除菌。肉食品经微波杀菌后，其新鲜度、嫩度、口味均维持原状，食品卫生标准彻底可小于我国食品质量标准，仓储货架存储时间达到1-2月，微波加热对肉食品除菌、冷藏技术性的取得成功运用，由原先新鲜期3天，增加到1-2月，已将此项科技成果提升到全新环节。