“尼米兹”级舰同以前的航母一样，由其自身发展的要求，选择了不利于阻力的肥大船型。就其内部居住性标准而言也不高。重量分配是航母设计师颇费心计的问题。
从“福莱斯特”号以后的超级航母虽然排水量不断增大，但吃水变化很小，而是在长度和宽度上增加。这种变化一是受港口和船坞水深条件的限制，二是获得了有利飞行作业的尽可能长的甲板长度和宽度，即扩大了飞行甲板的面积。
在船体构造上也与前述的航母一致。机库甲板以下为水密结构，共分8层甲板(含双层底)。其型深为19.51米。两舷侧由底至机库甲板都采用古老的防雷隔舱结构，在内外两舰体之间有4道纵向隔壁。
这种防护型式在二战中被证明是行之有效地，只不过现在更加发展了，将其延伸至水线以上，使机库两侧也形成双层防御结构。沿舰长每隔12~13米便设一道水密横隔壁，共23道，并设有10道防火隔壁。从而形成了2000多个水密隔舱，就是这2000多个水密隔舱保证了舰的不沉性。在这些舱中采用空、实相间的措施，增强了舰的抗损能力。二战时，这些舱中就装淡水和舰用燃油。
现今，由于JP-5的性能较温和，是一种相对安全的燃料，所以在核动力航母的翼舱中也设有航空燃料舱，从而大大提高了航空燃油的装载量。两侧多层设置空、实相间隔舱和X形吸能支撑结构，以及HY-80以上的高强度结构钢，形成了航空母舰的坚固的被动防御体系。
甲板
飞行甲板距水面高为19.11米，距基线高为30.63米。由基线至桅顶高为74.37米。共有舱室3360间。从“福莱斯特”级以后的航母均采用闭式机库，飞行甲板为强力甲板，参加全舰的总纵强度。为此，即保证了高性能飞机着舰的要求，也解决了舰体加长后出现的舰体梁的纵向强度问题。
在舰体内，动力装置、弹药库等重要舱室布置在一个装甲箱体内，以防受损危及舰的生命。机库甲板至飞行甲板占4个甲板层高，为11.13m。机库占3个甲板层高，长度占水线长的66%。机库的周围布置航空车间。机库顶部为吊舱甲板(日本人称高射炮甲板)。
飞行甲板至吊舱甲板之间的广阔空间为航空联队的办公区。集中在飞行甲板舯部右舷侧的上层建筑被称为“岛”。在这里布置有司令舰桥、航海舰桥和飞行舰桥，实施对全舰飞行作业和舰队的指挥。此外，许多雷达等电子天线设置在其上，是全舰重要的中枢区。
装甲
马岛海战时对美航空母舰的发展影响很大。由于防御的加强，故排水量一增再增，现已突破10万吨大关。飞行甲板进一步强化，增设了消防装置和新设了呼吸装置。“林肯”号和“华盛顿”号在增加飞行甲板装甲的同时，在舰桥等处增设了防御装甲。