百草枯是触杀型，对于大的杂草通常药量不会死根，不过见效快，喷药后立竿见影;
草甘膦具有内吸传导性，小的杂草会吸收到根部，引起根部死亡。但草甘膦通常要7天以后才能见效，期间如果有降雨会影响药效。
用药后的症状
百草枯：中等毒性。但是对人毒性极大，且无特效药，口服中毒死亡率可达90%以上！目前已被20多个国家禁止或者严格限制使用。为速效触杀型灭生性季胺盐类除草剂。有效成分对叶绿体层膜破坏力极强，使光合作用和叶绿素合成很快中止，叶片着药后2－3小时即开始受害变色。可防除各种一年生杂草，对多年生杂草有强烈的杀伤作用，但其地下茎和根能萌出新枝；对已木质化的棕色茎和树干无影响。
草甘膦：属低毒除草剂，对人畜毒性低。为内吸传导型慢性广谱灭生性除草剂，主要抑制物体内烯醇丙酮基莽草素磷酸合成酶，从而抑制莽草素向苯丙氨酸、酷氨酸及色氨酸的转化，使蛋白质的合成受到干扰导致植物死亡。草甘膦是通过茎叶吸收后传导到植物各部位的，可防除单子叶和双子叶、一年生和多年生、草本和灌木等40多科的植物。草甘膦入土后很快与铁、铝等金属离子结合而失去活性，对土壤中潜藏的种子和土壤微生物无不良影响。