一、以违反公司规章制度为由解除合同
《劳动合同法》第三十九条 劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；
（二）严重违反用人单位的规章制度的；
（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（五）因本法第二十六条 第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）被依法追究刑事责任的。
在这样的前提下，公司首先要看下公司内部规章制度针对员工这类情况是如何规范的。员工的行为是否达到了制度中“严重”的程度。如果尚未达到，公司是无法单方解除的。这时，如果员工还是一而再、再而三的不配合工作，那么建议收集好这些证据，公司再次以发警告、再次警告的方式要求其服从工作管理，这样以凸显其“严重”不配合。
二、以不能胜任工作为由解除劳动合同
《劳动合同法》第四十条 有下列情形之一的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同：
（一）劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的；
（二）劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的；
（三）劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，经用人单位与劳动者协商，未能就变更劳动合同内容达成协议的。
不知贵司是否有绩效考核制度，贵司可以将绩效考核制度纳入员工管理，员工绩效不达标，那么属于不胜任工作，公司可以进行培训或者调岗，若培训或挑岗之后还是不能胜任，那么公司可以i 提前30天以书面方式通知解除劳动合同。