首先是外观的影响，这也是使患者就医的主要动机。更重要的是，斜视影响双眼视觉功能，严重者没有良好的立体视力。立体视力是只有人类和高等动物才具有的高级视觉功能，是人们从事精细工作的先决条件之一。如没有良好的立体视觉，在学习和就业方面将受到很大的限制。
大部分斜视患者都同时患有弱视。由于斜视患者长期一只眼注视，另一只眼将造成废用性视力下降或停止发育，日后即便戴合适的眼镜，视力也不能达到正常。在儿童时期患上斜视还会影响全身骨骼的发育，如先天性麻痹斜视的代偿头位，使颈部肌肉挛缩和脊柱发生病理性弯曲，及面部发育不对称。
斜视的主要危害是影响双眼单视功能，正常人能把双眼分别看到的两个影像合二为一，但由于斜视造成的眼位偏斜，患者就会有复视，混淆等一系列反应出现，久而久之产生抵制，影响双眼视的建立。双眼视缺乏就会影响孩子长大后职业的选择及心理健康。
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