首先纠正一下题主问题中的一个小误差，萧峰是用两支箭插入心脏而亡，并非是跳崖。跳崖的是阿紫（拖着萧峰的遗体）。
萧峰之死在他失手打死阿朱时就已经埋下伏笔。阅读《天空八部》到这一幕时意外沉重，也让读者明白萧峰是一个悲情人物，尽管他侠肝义胆，武功盖世，酒量过人。
让萧峰这样一位顶天立地的盖世英雄最终选择自尽的原因，是萧峰性格中的敢作敢当。更深层的原因，是作为江湖儿女的萧峰，身负深仇大恨却无法还手的极度纠结。
萧峰在被揭露身世之前，一直以为自己是大宋子民。且身为丐帮帮主，肩负着协助朝廷抗击契丹（大辽）的重任。在这之前，萧峰杀害过很多同族同胞，两国为敌，于他而言那是天经地义的事情。当他被马夫人出于难以理解的虚荣心，而设计陷害并被揭露身世之后，他内心开始升起迷茫。不过那时候首要的事情是寻找到当年的带头大哥，为父报仇。而在寻找带头大哥的过程中，所有知情人，包括自己的授业恩师在内都被“大恶人”抢先一步灭口。萧峰的仇恨渐渐转移到了这位“大恶人”身上。
更可悲的是，当谜底揭开，这位“大恶人”居然是自己的父亲。萧峰苦笑着说了一句：那这么多年来，孩儿是替父亲背负着恶名，倒也不冤。并对少室山群雄说到，哪位要为死去的亲人报仇，尽管来找我萧峰算账。
萧峰尽管知道自己是契丹人，但大宋毕竟是他自幼生活成长的地方，在他心中一直视大宋为自己的母邦。这种矛盾在萧峰内心中自始至终都存在，一直在挣扎，使他备受煎熬。所以萧峰作出了一个决定，要退出江湖和阿朱做一对牧羊人，远离江湖恩怨。而这个梦，又被他自己亲手打碎。
等到后来，萧峰力谏大辽皇帝耶律洪基不要南犯大宋，结果被囚。后来被以大宋江湖英雄为主，以及结义兄弟虚竹缥缈峰灵鹫宫属下的三十六洞洞主，和段誉手下的大理众人合力救出。当他们杀出一条血路到了雁门关，大宋守关官兵却拒绝打开城门。使得众人被皇帝亲率的大辽大军包围。萧峰生擒耶律洪基后，迫使他发誓有生之年绝不再冒犯中原。
这似乎是一个皆大欢喜的局面。但耶律洪基的一番话说到了萧峰的痛处。耶律洪基先是讥笑着叫了一声萧峰的官职“南院大王”，然后说这一下南朝皇帝肯定会给个更大的官来做吧？接着话锋一转，说萧峰不顾君臣之礼，结义之情等等，并下令三军，日后若萧峰踏上大辽国土一步，格杀勿论。
这正是萧峰无法面对的死结。身为契丹子民，威逼皇帝；同时，他又如何能够再度出任丐帮帮主带领昔日兄弟对抗大辽？情节发展到这里，萧峰唯有一死。
生命诚可贵，但对于萧峰这样的大丈夫而言，舍生取义才是生命最重要的价值。尽管作为读者，我们在阅读的时候深感惋惜。但掩卷沉思之际，面对家国、民族、身世、爱情、江湖恩怨……又觉得这应该是萧峰最好的结局。
最终萧峰选择了离开，因为他心里明白，他无法面对阿紫和以后还不知道的众多粉丝中的潜在钦慕者。