我们尝试复现Nature microbiology论文中的Figure2b,主要关注点是使用R语言的ggplot2进行堆积柱形图绘制,每个柱子单独配色,并调整四个图例的前后顺序。
为了进行复现,首先需要从论文中获取作图所需数据。在我们的实例中,数据需按列统计频率,这需分别运行四次代码以确保每个柱子的频率正确统计。
在统计过程中,我们发现与论文中的数据存在差异,目前尚未明确问题所在,需要进一步分析。
接着,我们使用ggplot2绘制堆积柱形图。确保每个柱子采用单独配色,这能清晰区分各数据类别。同时,调整图例顺序,确保信息传达准确无误。
值得注意的是,本文记录的是学习过程,可能存在错误,读者应批判性阅读。欢迎关注公众号“小明的数据分析笔记本”,分享R语言和Python数据分析与可视化案例、园艺植物相关研究笔记、生物信息学入门学习资源与个人学习心得。
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