非洲发病超过30例以上的流行至少有八次。 第一次：1976年6～11月。苏丹南部，共发病284例，死亡151例，病死率为53%。1976年9～10月间在民主刚果（前扎伊尔）扎伊尔周边地区，发现318个病例，280例病死，病死率88%。85例因共用注射器感染，继发者为医护和病人亲属。 第二次：1979年在苏丹的恩扎拉地区，发病33例，死亡22例，病死率为67%。 第三次：1994年6月在加蓬的明克伯、马科库地区及热带雨林采金区，发病49例，死亡31例，病死率63%。 第四次：1995年4月在民主刚果基奎特市及其周围地区发生，发病315例，死亡245例，病死率77%。继发病例多为治疗和护理人员，占所有病例的25%。 第五次：1996年2月～1997年1月在加蓬北部，发病60例，死亡45例，病死率75%。66人/97人流行源于接触了1只丛林中死亡的黑猩猩的21名村民，继发病例都参加病死者传统的葬礼。 第六次：2000年8月～2001年1月在乌干达北部的古卢、Masindi及Mbarara。共发病425例，死亡224例，病死率53%。 第七次：2001年10月～2002年3月在刚果共和国和加蓬，共发病123例，97例病死，病死率为79%。 第八次：2002年12月～2003年4月底，刚果共和国共发生感染病例143例，病死128例，病死率89%。流行原因与人类狩猎活动有关，与黑猩猩和其他哺乳动物接触而感染。 最近一次为2005年4～6月，在刚果（布）发病12例，发现9例病人均死亡。经尸检取样化验后证实。
其他地区病例报道
（1）流行区感染，异地发病。到目前为止，英国、瑞士报道过输入病例，均为流行区旅行，参与诊治病人或参与调查研究人员。没有流行。 （2）实验室感染。至今报道明确的埃博拉实验室感染至少有2次，一次为1976年，英国Porton Down微生物研究所（RME），一工作人员实验室内转移埃博拉感染的豚鼠肝匀浆时针头刺入大拇指而感染。另一次为2004年5月俄罗斯维克托实验室，一女科学家意外被感染病毒的注射器针头扎破手指，感染发病死亡。
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