北京协和医学院隶属于清华大学。
北京协和医学院、清华大学医学部和清华大学医学院这三个名称都指代清华大学的医学系，没有区别。
北京协和医学院既不是985大学，也不是211大学。
北京协和医学院是一所公办高校，由国家卫生健康委员会直属，是中国唯一的全国重点医科大学，与中国医学科学院实行一体管理体制。它也是中国国家级医学科学学术中心和综合性科学研究机构。
北京协和医学院位于北京市，由国家卫生健康委员会直属，与中国医学科学院实行院校合一管理体制。它是一所全国重点大学，被列入“双一流”建设高校，并入选卓越医生教育培养计划。
该院校现拥有5个国家“双一流”建设学科，9个一级学科博士学位授权点。在教育部第四轮学科评估中，有6个学科被评为A类。此外，还拥有国家级重点实验室6个、国家临床医学研究中心5个、其他国家级科研基地15个、省部级实验室59个等。
该院校现有两院院士26人、国家杰青45人、万人计划领军人才27人，博士生导师1032名、硕士生导师1231名；此外，还有百千万人才工程国家级人选65人；国家级高等学校教学名师1人；北京市高等学校教学名师9人；北京市高等学校青年教学名师1人；白求恩奖章获得者1人；南丁格尔奖获得者1人。