卫生局医疗纠纷处理调解程序如下：调委会指定人民调解员主持调解，医患双方当事人参加调解，调解应当在专门设置的调解场所进行，调解人员进行调解时应当做好调解笔录，经调解达成协议的医疗纠纷，按照双方当事人达成的协议制作书面调解协议书，经调解未达成协议的医疗纠纷，告知其他解决途径。
《医疗纠纷预防和处理条例》第四条 处理医疗纠纷，应当遵循公平、公正、及时的原则，实事求是，依法处理。 《医疗纠纷预防和处理条例》第三十一条 申请人可以以书面或者口头形式申请调解。书面申请的，申请书应当载明申请人的基本情况、申请调解的争议事项和理由等；口头申请的，医疗纠纷人民调解员应当当场记录申请人的基本情况、申请调解的争议事项和理由等，并经申请人签字确认。 医疗纠纷人民调解委员会获悉医疗机构内发生重大医疗纠纷，可以主动开展工作，引导医患双方申请调解。 当事人已经向人民法院提起诉讼并且已被受理，或者已经申请卫生主管部门调解并且已被受理的，医疗纠纷人民调解委员会不予受理；已经受理的，终止调解。