雅鲁藏布江流域的森林和野生动植物资源在全国名列前茅,常见的成林树种主要有松、杉、柏等。
主要的野生植物有药用植物、糖类和淀粉类植物、纤维植物、油脂植物、芳香油植物、鞣类植物等6大类,其中以药用类最为丰富,达1000多种,有的畅销国内外。
野生动物兽类中的藏羚羊、野牦牛等系青藏高原特产珍稀动物,白唇鹿为我国特有的世界珍稀动物。鸟类有473个品种,其中西藏黑颈鹤为我国所特有。鱼类共有64种,以鲤科的鱼类为最多。
雅鲁藏布江流域的森林资源非常丰富,在波密、察隅、珞瑜等地,海涛般的森林随着山峦起伏,还有濒危珍稀的红豆杉。流域内有原始森林264.4万公顷,木材蓄积量8.84亿立方米。茫茫林海中,树龄200多年的云杉,有的高达80米,一棵树就可出60立方米的木材。
雅鲁藏布江畔有国家二级保护树种雅江巨柏,木质坚硬,性喜沿水线生长,生长期较长,少则几百年,多则上千年万年,它以顽强的生命力深深扎根于沙石之中。其形态各异,或弯或直,或倾或卧,似巨大的毛笔倒写着天上文章,为世人展示其千年沧桑。
雅鲁藏布江流域有高等植物2000多种,含木本植物100多种、药用植物和真菌植物165种,其中有虫草、灵芝、猴头、天麻、雪莲、红景天、贝母、松茸等,可以说是一座天然的高原植物宝库。