技术不同:目前的会计电算化系统主要是为单功能计算机建立的，因为它在成立之初就受到环境的限制。后来，会计电算化软件也是在此基础上发展和完善的，会计是在网络环境下设计的，其实现的主要手段是计算机网络和现代通信等新信息技术。
信息输出对象不同:会计电算化系统主要是为财务部门建立的。设计只考虑财务部门的需要，财务部门输入会计信息，产出只能由财务部门打印，然后提交给其他机构。会计是企业业务处理和管理信息系统的一个组成部分，其大量数据直接从企业内外的其他系统获得，产出也依赖于各机构和企业内部的其他系统。企业内外各部门根据授权直接进入系统。
功能范围和会计程序不同:会计电算化是对人工会计系统的一种改进。是在手工制作的基础上制作的，所以其会计程序也被手工会计程序所模仿，也被开始了簿记凭证。最后，实现了计算机记录、转移和提供经济业务报告的功能。而会计是为了适应时代的要求。根据现代信息的及时性、准确性和实时性特点制作。它是从管理的角度设计的。具有企业会计、会计信息管理和决策分析等功能，其会计程序是以会计目标为基础的，按照信息管理和信息技术的原则来实现重组会计流程
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