在临床实践中，盐酸莫西沙星与以下药物的相互作用尚未得到证实：
对于这些药物，通常无需调整剂量。然而，莫西沙星与抗酸药、矿物质和多种维生素存在交互作用。这些物质中的多价阳离子可能形成多价螯合物，导致药物吸收减少，血浆药物浓度低于预期。因此，建议在服用莫西沙星4小时后或2小时后，至少间隔服用抗酸药（如去羟肌苷）、含镁或铝制剂、硫糖铝，以及含铁或锌的矿物质。
雷尼替丁与莫西沙星合并使用时，对药物吸收参数无明显影响，胃酸对莫西沙星的吸收无显著影响。大剂量钙补充剂对莫西沙星的影响轻微，不具临床意义。茶碱的研究显示，莫西沙星对茶碱的药代动力学无明显影响，表明它对P450酶的1A2亚型无影响。华法令的联合使用未发现对药代动力学和凝血参数产生影响。
口服避孕药与莫西沙星无明显相互作用，抗糖尿病药物格列本脲也是如此。伊曲康唑与莫西沙星同时使用时，伊曲康唑的暴露量有轻微变化，且对莫西沙星的药代动力学无显著影响。吗啡和阿替洛尔的药代动力学受莫西沙星影响轻微。
丙磺舒对肾脏排泄功能的研究未发现对莫西沙星清除率有明显影响。地高辛方面，莫西沙星对地高辛的药代动力学影响不大，不会显著改变稳态参数。活性炭在药物过量时可以减少莫西沙星的全身暴露，但静脉给药后影响较小。食物和乳制品摄入不会影响莫西沙星的吸收，因此服用时间不受进食影响。