如题所述
法律分析：公司项目合作协议盖可以盖合同章也可以盖公章，这两者都是具有法律的效力，一般需要由双方协商来进行处理，双方在订立此协议时就需要双方协商一致，这样才能确定到双方的权益。
法律依据：《中华人民共和国公司法》
第一条 为了规范公司的组织和行为，保护公司、股东和债权人的合法权益，维护社会经济秩序，促进社会主义市场经济的发展，制定本法。
第二条 本法所称公司是指依照本法在中国境内设立的有限责任公司和股份有限公司。