高颜值在线绘图平台ImageGP系列教程

如题所述

在线平台BIC,访问路径为 bic.ac.cn/BIC/#...或通过百度搜索,是ImageGP的升级版,于2020年初进行重构。该平台使用配置文件快速部署工具,提供结果或结果报告生成功能,其绘图与分析基于R语言(ImageGP包,基于早期ImageGP脚本封装)、Python语言。


平台累计使用超70万次,被引用多次。左侧导航包含专业图形快速绘制、数据转换与提取、生物信息分析、互动可视化与资源部分。


功能详解


专业图形快速绘制

支持16种基本图形,包括热图、箱线图、富集分析泡泡图、柱状图、火山图、PcOA分析、Venn图、直方图、线图等。每种图形根据复杂度,设有不同数量的可调节参数,能组合生成复杂复合图形。


数据转换与提取

提供常见数据格式转换功能,如宽矩阵转长矩阵、长矩阵转宽矩阵、合并矩阵、矩阵膨胀等。


生物信息分析

包含共表达网络分析(WGCNA)、特征物种鉴定(LEfSe)、差异基因/物种分析(Limma)、多序列比对、FASTA处理、RNA翻译、正则匹配与空间关系等工具。更多分析工具持续完善中。


互动可视化

基于D3.js的互动图系列,目前展示进化树与多序列比对。未来将陆续加入更多互动图。


教程与资源

提供网站使用指南、常用教程、经典书籍推荐与网址导航,内容持续更新。

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