厦门港澳通行证办理在厦门公安局出入境管理局办证大厅办理。
办理时要提供本人居民户口簿及复印件、居民身份证及复印件、一张小2寸半身免冠数码照片（除了照片之外其他都需要先准备好复印件）。需要注意的是，首次办理港澳通行证的必须由本人亲自办理，办理之后两周左右可以领取证件。
港澳通行证办理流程：
1、领取申请表居民携带本人身份证和户口簿到当地出入境管理机关，领取一张《中国公民往来港澳地区申请审批表》，国家工作人员等要由单位出具意见。不满14周岁的居民在办理申请时，须由父母或法定监护人陪同。
2、填写申请表申请表要用蓝黑色或黑色水笔填写。申请表要填写姓名、身份证号码、家庭住址、申请种类、申请事由等内容。身份证须填写18位号码。
3、复印身份证、户口簿，照相申请表内容填好后，申请人要将身份证和户口簿个人资料的复印件粘贴在申请表背面。申请人将一张近期正面白底免冠半身、光面头像照片贴在申请表上，相片尺寸：48×33mm。服务大厅里有照相服务点。
4、申请人根据本人所选择的签注种类先到服务大厅或出入境管理机关下的建设银行交纳个人旅游证件工本费和签注费。
5、向工作人员提交资料申请人持交费发票、已填好的申请表、身份证户口簿原件及复印件在服务台交验资料，并回答民警有关询问。完成申请手续后，民警会给你《回执》单，上面有工作电话。
6、按规定时间取证，往来港澳通行证自受理之日起10个工作日内办结，申请人在等证期，可以拨打《回执》单上的咨询电话询问办证的进展程度。
法律依据
《中国公民因私事往来香港地区或者澳门地区的暂行管理办法》
第九条 内地公民因私事申请前往香港、澳门，须回答有关的询问并履行下列手续：
（一）交验户口簿或者其他户籍证明；
（二）填写申请表；
（三）提交所在工作单位对申请人前往香港、澳门的意见；（四）提交与申请事由相应的证明。
第十条 本办法第九条第四项所称的证明是指：
（一）夫妻团聚，须提交合法婚姻证明，以及配偶在香港、澳门有永久居住资格的证明；（二）去香港、澳门照顾年老体弱父母或者无依无靠的老人、儿童投靠香港、澳门亲属，须提交与香港、澳门亲属关系及其在香港、澳门有永久居住资格的证明；
（三）继承或者处理产业，须提交产业状况和合法继承权的证明；
（四）探望在香港、澳门亲属，须提交亲属函件；时间急迫的，应尽可能提交与申请事由相关的说明或者证明；
（五）会见台湾亲属或者会见居住国外的亲属，须提交亲属到达香港、澳门日期的确切证明。
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