1、班子配备不齐。部门纪检工作分管领导为现实所累。
2、“兼任”干部难以脱身。区县多数部门没有配备纪检组长，纪检工作多数是部门领导兼任。
3、“新兵蛋子多”影响纪检监察职能作用的发挥。
落实“三转”需要注意的事项：
1、党委、政府一把手要作表率，特别是在纪委书记分工调整上要支持，弄清楚应该“做什么、不做什么。”纪检干部就是要干好纪检本职，就是要抓干部作风建设，就是要抓预防和惩治腐败。坚决要退还别人的“责任田”，要从兼职中彻底解脱，干好自己的事，保证纪检组长姓“纪”。
2、党委、政府要在纪检监察内设机构调整上给与支持，在纪检监察机关的干部使用和人员配置上给与支持，要避免“一人局、两人局”的出现，确确实实地给人、财、物的支持，真正把财务、审计、检察院等专业人员充实到纪检队伍，为“三转”到位创造环境。
3、以老带新，尽快让新兵变成老兵。多开展实战培训，让纪检干部融入到纪检工作的的氛围中，让有经验的同志带队开展纪检监察工作，让纪检干部在实践中学习，共同办案，快速成长，避免胡干，蛮干、乱干。
3、强化纪检监察干部的思想教育，树立科学的权力观、政绩观，改变纪检监察干部的专门工作考核、任用评估机制，提升纪检监察干部履职保障和待遇，提升纪检监察干部的职业荣誉感。