主要区别在于
机械制造及其自动化专业偏向机械方面，自动化专业主要研究自动控制理论以及电气、电子等方面内容。
机械制造及其自动化是一门研究机械制造理论、制造技术、自动化制造系统和先进制造模式的学科。该学科融合了各相关学科的最新发展，使制造技术、制造系统和制造模式呈现出全新的面貌。
自动化专业专业有三个发展方向，第一个是工业过程控制方向，第二个是
电气工程方向，第三个是嵌入系统方向。
1．工业过程控制方向：以自动控制、
计算机技术为支撑，针对实际工业生产过程实现自动控制，由信号检测与变换、过程控制、计算机控制系统、智能控制和现场总路线控制技术等组成方向主干课。
2．电气工程方向：使学生能够从事
电力系统自动化、工厂企业、楼宇系统的供电和电气控制、监控等领域的设计开发、维护和管理工作。由电气控制技术、运动控制、PLC应用技术、供电技术、电力系统继电保护等组成方向主干课。
3．嵌入系统方向：注重对
嵌入式系统设计与软件设计能力的培养，理论结合实践，通过课堂教学、实验等多种形式的学习，培养嵌入式系统方向的专业人才；由嵌入式系统设计、嵌入式实时操作系统、
DSP技术、先进显示技术、控制电机等组成方向主干课。