请问，用RNA 检测融合有哪些需要考虑的质控参数？怎样保障检测的准确性？

Question

如题所述

Answer 1

近日，《中国肺癌杂志》发布了全球首部非小细胞肺癌DNA+RNA同步共检专家共识，复旦大学附属肿瘤医院的周晓燕教授认为，RNA完整性和纯度是RNA质控的重要参数。RIN值是基于18S和28S rRNA电泳图分区计算得出的RNA降解程度，范围是0-10，数值越高说明RNA完整性越好。反映RNA完整性的另一参数是DV200，即超过200个核苷酸的RNA片段的百分比，阈值通常为30%。对于RNA纯度的评估，可以通过紫外分光光度法检测样品吸光值A260/A280及A260/A230的比值反映RNA纯度，纯RNA理论值为A260/A280=2.0，A260/A280比值低于1.7表明存在蛋白质污染，A260/A280大于2.0表明有异硫氰酸污染，A260/A230比值通常在2.0-2.2，A260/A230小于2.0表明有酚盐、硫氰酸盐或其他有机化合物污染。质控是RNA-based NGS检测结果准确性的保障，不仅在RNA质控方面，还要在文库质量、测序深度、下机数据质量、数据分析以及融合功能判断等各环节设置质控点。因此，建议在具有完善的分子病理质量管理体系、并具有NGS检测和分析能力的实验室开展RNA方法的融合检测，以确保检测结果和临床报告的准确性。