2020年6月，中国新冠肺炎病理团队在权威期刊国家科学评论(National Science Review)在线发表题为“Autopsy of COVID-19 victims in China”的研究论文，由卞修武院士的团队及新冠肺炎病理团队对91名新冠肺炎害者进行了病理检查和诊断。此次发表的论文是对91例新冠肺炎患者尸检病理结果总结。
研究指出，新冠病毒会影响多个器官不同程度的急性损伤。例如，食道，胃和肠粘膜上皮表现出不同程度的变性，坏死和剥落；睾丸显示出不同程度的生精细胞减少和损伤；脑充血和水肿，部分神经元变性和缺血性改变；肝脏显示出肝细胞变性，斑点坏死；肾脏表现为肾小球充血，节段性增生或坏死，肾小球包膜腔内有蛋白质渗出。
“睾丸出现生精细胞减少，可能会影响男性的生殖能力。”一位不愿具名的生殖科医生告诉记者，不过，从目前的研究只能说有相关性，两者并不一定有直接关系，尸检的患者多为重症患者，很有可能是出现炎症风暴，才导致多器官损伤。
华中科技大学同济医院生殖医学中心李豫峰教授提醒，新冠肺炎病毒可能造成睾丸损伤，感染新冠肺炎的适龄男性，在康复后应进行生育力检查。
此外，该研究团队人员称，从这91例新冠肺炎尸检病理结果发现，新冠病毒颗粒存在于重症老年患者的多个器官中，例如消化道，皮肤和各种体液等。这或许表明新冠存在多种病毒传播途径。
上述那位生殖科医生告诉记者，“如果从男性的睾丸以及精液中都检测出新冠病毒，则要警惕新冠通过性行为传播的可能。不过，目前的研究还没有相关证据。”
“新冠肺炎之所以难以控制，在于病毒不仅打击人的肺，还打击心脏，打击消化道，打击肾脏，打击凝血，旨在快速瘫痪人体的免疫系统”。 中日友好医院呼吸与危重症医学科主任詹庆元博士表示。
2020年3 月，国际医学期刊《柳叶刀 – 胃肠病学和肝脏病学》在线发表了中国科学院院士、解放军总医院第五医学中心(302 医院)教授王福生团队的评论文章《COVID-19 相关的肝损伤：诊治与挑战》指出，不管是在新冠肺炎轻症还是重症患者中都存在一定比例的肝脏功能异常情况。
武汉大学人民医院感染科主任龚作炯曾在接受健康时报记者采访时介绍，从临床观察以及已经发表的文献来看，病人主要的损害还是以肺部的损害为主，有些病人伴有一定程度的肝脏损害，可能和几方面的原因有关系。一是继发性的肝脏损害，二是因为在治疗中有时用药比较多，在某种程度上也可能表现为药物性损害。三是危重症患者出现呼吸窘迫综合征，导致病人出现一个多器官的损害，这不仅是损害肝脏或是损害肺，还可能伴有心脏、肾脏等问题。
“对于重症患者而言，与新冠病毒的斗争是一场杀敌一万、自损八千的过程，命虽然重症患者救活了，但全身机体多器官受到损害。”湖北省防疫专家组成员、华科同济医院感染科主任医师宋建新告诉健康时报记者。
神经系统：新冠病毒或影响大脑在《神经病学专业防控新型冠状病毒感染专家共识(第一版)》中指出：有一部分患者合并神经系统症状，例如突发吐词不清、肢体瘫痪等急性脑血管病症状；头痛、癫痫、意识障碍等颅内感染症状；四肢酸痛、无力等肌肉损害的症状等。“试行第七版”病理性改变部分，也增加了脑组织充血、水肿，部分神经元变性的内容。
中山大学附属第六医院神经科主任李中在接受健康时报记者采访时表示， 如果是新冠肺炎重症感染者，由于全身免疫力低下，或会导致脑炎、脑膜炎等发生。一些重症患者继发颅内感染后，还可能出现头痛、喷射性呕吐、视力下降、肢体抽搐等神经系统的表现。
目前来看，新冠病毒对神经系统的影响，都是在感染重症患者中可能发生的，即使受影响，也大多是新冠感染后的并发症。由于常人有完整的血脑屏障和良好的自身免疫力，能较好抵抗病毒的侵袭。
患者需要进行呼吸机辅助呼吸，同时应用生命支持系统进行对症治疗，以使患者的生命体征趋于平稳。新型冠状病毒肺炎的致死率很高，临床上一定要在医生的指导下规范的使用中药、西药抗病毒治疗，常用的像干扰素、利巴韦林，以及痰热清注射液、喜炎平注射液等等共同调治。