一、按月集中诊断办理流程
(一)申报
只要是在我市参保的参保人居住在本市各区县，可在各区县就近申报和体检;
本人或其委托人向参保所在区县医保局或其指定的机构申报。
所需资料：《重庆市医疗保险特殊疾病申报表》;身份证或社保卡原件;近期2张1寸免冠照片;委托他人办理需要被委托人的身份证原件以及双方签字的委托书。
(二)体检
参加区县医保局每月组织的集中体检。
所需资料：本人的病史资料包括既往住院(就诊)病历及相关检查、诊断证明材料等。
(三)发证
体检鉴定后，符合特病资格的人员发放特病证。
二、快捷直接办理流程(遇到某些特殊情况)
参保人员患结核病，精神病，恶性肿瘤的放(化)疗和镇痛治疗，肾脏、肝脏、肺、心脏瓣膜、造血干细胞移植术后的抗排异治疗，肾功能衰竭的门诊透析治疗的，以及病情危重、卧床不起或高龄病人等特殊情况参保人可不参加集中体检，直接快捷办理。
办理流程：
(一)申报
本人或其委托人向参保所在区县医保局或其指定的机构申报。
所需资料：《重庆市医疗保险特殊疾病申报表》。
(二)办理
到区县医保局指定的(或市级明确的)具备相关鉴定资格的医院进行诊断。
申报人(带上身份证及身份证复印件)或被委托人、监护人(带上申报人和被委托人身份证、申报人身份证复印件和委托书)携带申报人以下资料：
《重庆市医疗保险特殊疾病申报表》、与申报病种相关的门诊病历原件、住院病历复印件(加盖医院专用章)、检查资料原件(或复印件加盖医院专用章)，以及社会保障卡原件，到医保局指定的(或相关文件明确的)具备相关鉴定资格的医院检查鉴定，原则上不作重复检查，检查鉴定结束，医院为申报人出具《重庆市医疗保险特殊疾病诊断证明书》。
(三)发证
凭医院出具的《重庆市医疗保险特殊疾病诊断证明书》到区县医保局办理特病证。