乡镇公务员的待遇一般比乡镇科员要好一些。具体来说，乡镇公务员的工资、福利等方面通常会比乡镇科员更加优厚。
首先，乡镇公务员和乡镇科员在职务等级上存在差异。公务员是指国家机关中正式编制的工作人员，而科员则是公务员中的一种职务等级。因此，乡镇公务员的职务等级一般比乡镇科员高，相应的工资、福利待遇也会更好。
其次，乡镇公务员和乡镇科员的工作性质也有所不同。乡镇公务员一般是负责行政管理、执法等工作，而乡镇科员则更多是从事一些具体的事务性工作。因此，乡镇公务员的工作相对更加重要和复杂，需要更高的素质和能力，因此其待遇也会相应更高。
另外，乡镇公务员的晋升机会也相对更多。由于公务员是国家机关中的正式工作人员，其晋升渠道和晋升机会一般会比乡镇科员更加广阔。
综上所述，乡镇公务员的待遇一般比乡镇科员更好，这主要是因为公务员的职务等级更高、工作性质更加重要和复杂，以及晋升机会更多。当然，具体待遇还需要根据不同的岗位和地区来确定。