动物托运检疫证明通常需要在当地的动物卫生监督所办理。如果当地没有动物检疫站，可以咨询当地的宠物医院，有些宠物医院提供代办服务，甚至能够直接办理。办理时需要携带个人身份证、居住在虹口的证明（如居住证、租房合同或居委会开具的证明）、动物临床检查记录表和狂犬疫苗本。现场可以复印资料，资料齐全的情况下可以当场拿到合格证明，但该合格证明的有效期仅为5天。
宠物托运流程如下：
1、需要先将宠物的疫苗本准备好。
2、装宠物的航空箱或者笼子、准备好食物喝水，航空箱内需要垫尿垫、笼子需要选择带托盘的。
3、提前和航空公司咨询，航班是否可以托运宠物。不是每一趟航班都可以托运宠物，有有氧舱的航班才能托运宠物，同时需要申请有氧舱。
4、提前确定好宠物托运行程，将宠物带到当地动物检疫部门，为宠物办理动物检疫证明。
5、办理好相关手续，带着宠物和相关手续提前3小时到机场行李处办理宠物托运手续。
综上所述，宠物托运是指按照国家法律规定，对宠物进行远距离、中距离、近距离的护送运输。宠物托运是物流中一种特殊的托运形式，指托运人委托具有托运资质的宠物托运公司将宠物运输到指定地点，交给指定收货人的服务。
【法律依据】：
《中国民用航空旅客行李国内运输规则》
第四十四条
小动物是指家庭饲养的猫、狗或其他小动物。小动物运输，应按下列规定办理：旅客必须在定座或购票时提出，并提供动物检疫证明，经承运人同意后方可托运。旅客应在乘机的当日，按承运人指定的时间，将小动物自行运到机场办理托运手续。
装运小动物的容器应符合下列要求：
（一）能防止小动物破坏、逃逸和伸出容器以外损伤旅客、行李或货物。
（二）保证空气流通，不致使小动物窒息。
（三）能防止粪便渗溢，以免污染飞机、机上设备及其他物品。旅客携带的小动物，除经承运人特许外，一律不能放在客舱内运输。小动物及其容器的重量应按逾重行李费的标准单独收费
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