两者合作办学关系，但并未合并。
北京协和医学院不属于清华大学，北京协和医学院只有临床专业与清华大学合作，护理专业、附属医院、临床教学基地和其它均属于北京协和医学院。
自2003年起，协和临床医学(八年制)专业的招生计划纳入清华大学总招生计划，由两校共同完成招生录取工作。报考协和“临床医学(八年制)”专业的考生，在填报志愿时应报清华大学临床医学专业，并可同时报清华大学其他理工类专业。
临床医学专业的学生和研究生毕业证书和学位证书盖“清华大学”和“北京协和医学院-清华大学医学部”两个公章。
2006年签署的《清华大学和中国协和医科大学关于落实两部协议的实施意见》明确：
中国协和医科大学更名为“北京协和医学院-清华大学医学部”，接受教育部、卫生部双重领导，其原有的隶属领导关系、资产关系和经费管理体制保持不变。“北京协和医学院-清华大学医学部”仍为独立法人，对人事、财务和资产行使独立法人权利及承担独立法人责任。
不过，2007年，教育部与卫生部关于此事的新协议明确：中国协和医科大学正式更名为“北京协和医学院”;鉴于与清华大学紧密合作办学的需要，同时使用“北京协和医学院—清华大学医学部”的名称。
北京协和医学院-清华大学医学部的学科建设由清华大学纳入“211工程”和“985工程”等国家重点建设工程的整体规划及其他相关计划之中，在政策和投入等方面给予重点支持。
两者是合作办学关系，但并未合并。北京协和医学院不属于清华大学，北京协和医学院只有临床专业与清华大学合作，护理专业、附属医院、临床教学基地和其它均属于北京协和医学院。
北京协和医学院由美国洛克菲勒基金会于1917年创办，是我国最早设有八年制临床医学专业和护理本科教育的重点医学院校。
清华大学隶属于教育部，前身清华学堂始建于1911年，因水木清华而得名，是清政府设立的留美预备学校，其建校的资金源于1908年美国退还的部分庚子赔款。
北京协和医学院-清华大学医学部的学科建设由清华大学纳入“211工程”和“985工程”等国家重点建设工程的整体规划及其他相关计划之中，在政策和投入等方面给予重点支持。
为探求中国高等医学教育改革的创新模式，北京协和医学院与清华大学于2006年9月起开展合作办学，可同时使用“北京协和医学院——清华大学医学部”作为第二名称，并依托清华大学，部分进入“211”和“985”工程平台建设行列，但是两家还是分开自主招生和教学。
协和护理教育自开办以来，一直为全国各地培养输送护理人才。建校以来护理专业共毕业学生数千名，连年就业率达到100%。自1983年我院1931届毕业生王琇瑛先生成为我国第一个南丁格尔奖章获得者起，至今已有6名毕业生获此殊荣，为我国护理院校之首冠。
大多数毕业生成为护理行业的领导及骨干，协和护理教育为推动中国护理事业的建设和发展发挥了重要作用。
协和医学院坚持小规模招生、高层次培养、高质量输出的办学宗旨，在长期的办学实践中，凝练出“坚持医学精英教育、实行高进优教严出、注重能力素质培养、强调三高三基三严、开放办学博采众长、传扬优良文化传统”的办学特色。
协和医学院是首批具有博士学位和硕士学位授予权的单位，现有一级学科博士授权专业点8个、一级学科硕士授权专业点3个，是国务院学位委员会自行审核博士学位授权一级学科点和硕士学位授权一级学科点的委托学位授予单位。
现有一级学科国家重点学科 2个，二级学科国家重点学科8个，三级学科国家重点学科2个，国家重点培育学科1个。
本回答被网友采纳北京协和医学院加挂清华大学医学院的牌子，
本科以清华大学名义对外招生，
护理学自行招生。
北京协和医学院是独立办学。本回答被网友采纳