马有64条染色体，驴有62条染色体，杂交后产生的骡子有63条染色体。在有性生殖过程中产生性细胞的减数分裂过程中由于染色体数是奇数会使减数分裂联会紊乱无法正常分裂，产生性细胞的几率太小。所以不能分裂。这也是不同物种之间的生殖隔离的表现，子代不育。
骡子的染色体数是63条。骡子性成熟以后，再形成精子或卵子时，每条染色体都没有相对应的同源染色体进行配对，这样每一条染色体分到哪个配子里是随机的，就可能有马的1条染色体和驴的30条染色体形成一个配子，另一个是1条驴的染色体和马的31条染色体形成一个配子；再由马的2条染色体和驴的29条染色体形成一个配子，另一个是马的30条染色体和驴的28条染色体形成一个配子……依此类推，这样就可以产生232（接近429500万）个不同类型的配子。在这些配子中，只有配子里的染色体完全来自于马的，或来自于驴的，这样的配子才有生育能力。
在任何生物体内，都存在着遗传物质——染色体。在不同种的生物中，染色体的数目、形态、大小都不同。在体细胞内染色体是成双存在的，每一条染色体都有一条和它的形态、大小、功能相同的另一条染色体，其中一条来自母体，一条来自父体。这两种染色体称为“同源染色体”。在形成精子或卵子之前，同源染色体进行配对，然后两条同源染色体分别到两个配子（精子或卵子）里去，其中哪一条染色体到哪个配子里去是完全随机的，再通过精卵结合成为受精卵，由受精卵发育成为新个体。这样发育成的新个体，它的染色体数目和它们的亲体是一样的。
据资料显示骡子似驴非驴，似马非马，比驴、马都高大，耕挽能力也胜过它们。驴骡出生后一般长到不足10个月就和它的妈妈能力相等。其后便逐渐超过它的妈妈。驴在4～6岁时，才达到其成年体格的95％，而驴骡1周岁时即达成年体格的90％。一般骡子一周岁半开始干轻活，2岁即可完全投入耕挽服役。骡子是民间喜爱饲养的一种家畜，力气大，能干活，一头体壮的中型骡，拉木轮大车，能挽重500公斤，日行30～40公里；如套胶轮大车，行于公路之上，挽重1500公斤不成问题。这是“杂交优势”所给予它的长处。