法律分析：两年内丢失的发票都可以到医院去补。医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。医疗收费票据是会计核算的原始凭证，是财政、卫生、社保、审计、监察等部门进行监督检查的依据，医疗收费票据是按照国家有关规定申请医疗费用报销的有效凭证。
申报新农合报销必须凭医院开具的原始报销发票(即发票原件)，一旦丢失将不能报销所有费用。但是针对近年来发生的无法报销的难题，医保在人情上给出了妥协，两年内丢失的发票都可以到医院去补，如果你可以补到的话就可以正常报销了。首先，可以先打个电话到医院财务部，说明情况，问如何补，需要什么材料。一般的话，需要出院小结，报销单位的证明(比如保险公司报销的，就到保险公司开者就职单位，居委会，村委会都行)，看病时用的磁卡和医疗记录本，差不多就这些材料，就可以去医院财务部补打印。
其次，一般医院会有指定时间去补，不是每天都有的。所以要问清楚。如果是挂号的发票，需要再挂号处去补。最后，补到了发票，这样就可以不耽误报销啦。发票丢了后可以去补发票，医保还是能报销的。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》 第三十条 下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围：(一)应当从工伤保险基金中支付的二)应当由第三人负担的三)应当由公共卫生负担的四)在境外就医的。