医保门诊统筹按人头付费的意思是医保中心与医院结算门诊费用是按人次乘以核定的次均门诊费用。
财政部、人力资源社会保障部和国家卫生计生委联合发布《关于加强基本医疗保险基金预算管理发挥医疗保险基金控费作用的意见》，其中明确提出实施基本医疗保险支付方式改革，全面实施以总额预算为基础，门诊按人头付费，住院按病种、按疾病诊断相关分组（DRGs）、按床日付费等多种方式相结合，适应不同人群、不同疾病及医疗服务特点的复合支付方式，逐步减少按项目付费，将支付方式改革覆盖所有医疗机构和医疗服务。
门诊统筹按人头付费结算按照月度预付和年终清算相结合的方式进行。
结算公式：
月度门诊统筹基金应预付额=（签约医疗机构年度门诊统筹基金人均定额/12）×当月10日签约人数。
月度门诊统筹基金实际预付额=月度门诊统筹基金应预付额×95%。其中扣除5%作为考核金，在年度考核时根据考核成绩兑付。
年终清算总额=签约医疗机构年度应预付门诊统筹基金总额-签约医疗机构年度实际医疗费用垫付额。其中，年度应预付基金总额等于各月度门诊统筹基金应预付额之和。
年终清算时，门诊统筹签约医疗机构定额使用率不超过70%的，按项目结算方式据实结算，结余资金全部作为下年度预拨定额资金。