根据对板块构造环境，沉积物类型、地层层序和古生物群活动特点的分析，三叠纪以前，本区为频繁的板块活动期，三叠纪以后，本区形成统一大陆，地壳活动进入一个全新的发展时期，故地层划分可按两个阶段划分，同时将研究区划分出北秦岭地层亚区、西秦岭南亚带地层亚区、西秦岭北亚带地层亚区、摩天岭亚区、松潘亚区;同时西秦岭南亚带地层亚区又可划分为洮河地层小区、白龙江地层小区(图2.5)。
图2.5 西秦岭成矿带中东段地层分区图
2.2.1.1 北秦岭地层亚区
该亚区位于研究区北，指天水－唐藏断裂(商－丹断裂带西延)以北的地区，是秦岭造山带最复杂的构造区，前寒武系至第三系均有分布，但其主要特征是华北板块南缘沟、弧、盆活动大陆边缘基础上与扬子、秦岭板块先后俯冲、碰撞拼合、叠加中新生代陆内构造形成的复合构造带，区内主要包括秦岭群、宽坪群、丹凤群沉积－火山岩，及古生界海相沉积岩和中新生界断陷陆相沉积岩。
2.2.1.2 西秦岭北亚带地层亚区
该亚区夹持于天水－唐藏断裂和临潭－宕昌－凤县断裂之间，该亚区是西秦岭泥盆系分布最广地区，生物群发育，同时发育有石炭系、二叠系、三叠系，在新生代断陷盆地内形成陆相沉积。
2.2.1.3 西秦岭南亚带地层亚区
亚区位于临潭－宕昌－凤县断裂与迭部－武都－略阳断裂之间，亚带北部三叠系广泛分布，南部志留、泥盆系分布较广。以迭部－凤县断裂为界分为北部洮河地层小区和南部白龙江地层小区。
洮河地层小区，主要的地层为三叠纪具复理石建造碎屑岩;白龙江地层小区，主要地层特征为发育志留系含碳硅质岩为主的黑色岩系，富含有机质，地层中并夹有火山碎屑岩。
2.2.1.4 摩天岭地层亚区
此分区南以黑水断裂———青川－平武断裂为界(传统的摩天岭地层分区与扬子区的界线);西部以岷江断裂为界与若尔盖亚区相邻;北以玛曲－略阳断裂东段为界，处摩天岭地块及其北邻的勉略构造混杂带。自太古宙到中、新生代的地层均较发育。其中摩天岭地区以元古宙地层为主，勉略宁小三角区和勉略带以太古宙—古生代地层为主。
2.2.1.5 松潘地层亚区
北部以玛曲－略阳断裂的西段为界;南以黑水断裂为边界;东与摩天岭分区接壤。主要以中－上三叠统沉积为主。
近几年来，在该区东部的四川九寨沟附近隆康、塔藏等地原来认为是三叠纪的地层中发现了与泥盆系非常相似的一套沉积，下部基性火山岩非常发育，由爆发相玄武质火山集块岩、角砾岩、凝灰岩和溢流相熔岩组成韵律旋回。岩石组合特征与区域上的武都、康县一带的泥盆纪三河口群十分类似;同时，在隆康、塔藏一带的火山岩的灰岩石夹层中获得Palmatolepis gracilis sigmoidalis，P.marginifera为代表的一些晚泥盆世法门期的牙形石，时代属晚泥盆世应无疑(赖旭龙等，1995;杨恒书等，1995)。