双非与双一流的区别如下：
一、整体情况
由于不同层级的学校的资金投入上差异很大，“双一流”的高校国家投入较大，学校的科研经费多；而普通公办本科院校国家也有一定投入，但少很多，并且科研经费基本很少；三本和专科学校，很多都是民办院校，国家基本没有投入，因此，主要收入来自学生的学费，科研经费基本没有。
经费是一个学校的基础，有钱可以投入基建，更好的校园环境；招人，更高水平的老师；提升排名，招高考成绩更高的学生。比如深圳大学，由于当地经济较好，深圳市投入较大，有钱招聘优秀的老师，基础建设更好，这几年综合排名提升很快。
二、升学就业差异
1、升学差异
双一流的升学率比例比较高，当中包括保研率、统考研究生、海外升学三个部分。差异最大的部分是保研率，从清华大学的56%，逐步降低到内蒙古大学的10%左右。而双非院校中绝大多数没有保研资格，部分一本学校的保研率一般也在个位数，竞争非常激烈。
由于保研名额非常多，双一流高校的统考研究生比例一般在10%左右；这个比例跟普通高校的考研比率比较接近。排名靠后的高校，升学率基本在个位数左右。海外升学主要以排名靠前的985为主。
2、就业差异
部分就业岗位虽然没有明说，但是基本都是面向双一流学校，甚至有部分仅仅面向985院校。比如，公务员招考中的选调生和定向选调生仅仅面向部分双一流高校。世界500强的企业招聘基本也以双一流为主。
作为非常看重学历的金融业，部分头部企业更是要求985以上，甚至网络上还流传“清北复交之下无金融”的说法，虽然不见得正确，但是也说明了金融行业对学校要求之高。从整体薪资待遇上看，学校越好，薪资待遇越高。
但是，如《学历重要还是能力重要？高考考的好，不如大学学的好，大学毕业生薪资深入分析》一文所分析，学校间差异，远远小于校内学生间的差异。
三、学习目标上的差异
双一流学校学生的学习目标更清晰。清晰的目标让人的努力更为准确。
比如，清华大学的本科生中，14%的人选择出国，约58%的保研，约8%的考研，累计深造率约80%；约17%的人直接就业，基本选择的也是国内最好的政府、企业岗位。基本经过两三个学期的学习，就可以确定专业内部的排名，不管是深造还是就业，基本可以明确自己未来的努力方向。
出国的，基本可以确定学校的范围；保研的，基本可以确定学校的去向；就业的，基本可以圈定几个企业。相反，双非的学生，绝大多数去向是国内的中小企业，而这些企业千差万别。对于学生来说，非常不了解这些企业的要求，更不知道该如何准备。从目标的清晰程度角度来说，从清北到双非，目标的清晰度越来越低。