乌龟肠炎是否自愈，需要看肠炎的患病情况。
1、乌龟肠炎如果是初期的话，是可以自愈的，注意不要有太大的温差，并暂停投喂，一般情况下一个星期就会好。
2、乌龟肠炎如果是中期或者后期的话，需要及时将其病隔离，以免其传染，然后要用阿莫西林溶液浸泡病龟，也可以用土霉素。（如果乌龟还可以吃东西，可以将药物注射到小鱼或者小虾里面，常用的药物有氟苯尼考，但是如果乌龟已经闭口了，那么就需要进行药浴和皮下药物的注射，可以使用土霉素，每升水加入0.4到0.6克，然后一天浸泡三小时左右，同时增加氟苯尼考的皮下注射。）
如果主人发现乌龟患上肠炎，而不予理会的话，时间长了就会导致乌龟死亡。一旦发现乌龟患有肠炎，主人要立即将患病的乌龟隔离饲养，防止它传染给其他龟，先停止喂食，然后提高乌龟生活环境的温度，严重的话还需要药浴。
提示：
乌龟患肠炎后会有精神萎靡、食欲减退、皮肤干燥松弛等症状。在平时主人要定期对乌龟生活的环境进行清洁消毒，喂食的食物也要保持新鲜、干净。平时要注意饲料的选择，而且不要在温度太低的时候大量喂食，食物中的水分最好控干，或者多喂一些粗纤维植物。