辽宁省工商局网上年检系统企业申报操作流程主要包括以下步骤：
1. 企业登录工商局网站，进入年检系统；
2. 填写并提交年检报告书及相关材料；
3. 工商局对提交的材料进行审核；
4. 审核通过后，企业缴纳相关费用；
5. 工商局颁发年检合格证明。
首先，企业需要登录辽宁省工商局的官方网站，找到网上年检系统入口，并按照系统要求填写企业基本信息，获得登录账号和密码。随后，企业需要在线填写并提交年检报告书及相关材料。这些材料可能包括企业营业执照、财务报表、税务证明等，需按照系统提示一一上传。
提交完毕后，工商局会对企业所提交的材料进行审核。这个过程主要是对企业的经营状况、遵纪守法情况等进行检查。如果审核通过，企业需要按照要求缴纳相关费用，例如年检费用等。最后，工商局会颁发年检合格证明，表明该企业已经通过了本年度的工商年检。
需要注意的是，企业在进行网上年检申报时，应保证所提交的材料真实、准确、完整。如果材料不齐全或存在虚假情况，可能会导致审核不通过或受到相关处罚。此外，企业还需要及时关注工商局的通知和公告，以便了解最新的政策要求和申报流程。
总之，辽宁省工商局网上年检系统企业申报操作流程是一个相对简单、便捷的过程，企业只需按照要求进行操作，即可完成年检申报工作。