应该是有两方面的原因吧，首先，刘备和吕布之间是有仇的，如果曹操接受吕布投降，那么他们两个就等于同时在曹操手下打工，也就有可能发生冲突，到时候曹操指不定会向着谁说话，不要吕布的命，就等于给自己弄了一个现成的竞争对手，甚至性命有可能不保，所以他必须除掉吕布。
其次，吕布是三国时武力值最高的一员勇将，当年在虎牢关前，他们哥仨和人家打了个平手，要是一对一，基本上没有胜算，这样一个人假如被曹操调教过来，成了曹操的超级打手，会给刘备将来的霸业形成很大的威胁，毕竟刘备从没想过要在曹操手下干一辈子，他迟早要自立门户，与其到时候在战场上和吕布玩命，不如利用现有的机会一举将其铲除，费点唾沫比抡大刀要轻松的多。
第三，刘备通过察言观色，发现曹操其实也在犹豫不决，毕竟吕布是条好狗，就这么咔嚓了有点可惜，但是如果留下来又怕他反咬自己一口，于是刘备就轻轻的添上了一把柴火，让曹操觉得自己是真心为他考虑，提升一下自己的印象分。
白门楼杀吕布，其实曹操心想杀吕布又想留吕布，刘备就劝曹操把吕布给除掉，但是碍于不好直说，于是就说:“公不见丁建阳、董卓之事乎？”于是曹操就将吕布给斩了，刘备之所以提醒曹操自有深意。
其一，人中吕布，马中赤兔，号称战神吕布说杀就杀实在可惜，曹操一向惜才，当然心有犹豫，但是如果不杀，吕布归属曹操之后，势必挤兑自己，那到时候吕布、曹操可是一大患，吕布给了曹操，那刘备肯定处于劣势。
其二，吕布和刘备有深仇大恨，一开始刘备在徐州，安安稳稳的，谁也没惹，偏偏来了个落荒而逃的吕布，刘备好心接纳吕布，结果吕布以派兵为由，占据了徐州，刘备无奈，只得结盟曹操，而后报的此仇。
其三，刘备建议杀吕布，是为了得到曹操的信任，毕竟刘备是跟着曹操混的，自然要站在曹操这边，为曹操的利益着想了，因此刘备劝曹操不要留吕布，也是怕吕布会迟早造反。