法律分析：如果擅自离职，没有办完合法手续，出现相关劳动方面问题，劳动者需承担一部分责任，员工要离职法律程序，是维护自身权益的最好方式。员工交了辞职申请，但没办理离职手续，可以作自动离职处理。自动离职是指员工擅自离职而强行与用人单位解除劳动关系的一种行为。员工可能要承担赔偿责任。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的百分之二十。遇到员工擅自离职的，用人单位应当以书面形式送达通知书，限定员工在指定的时间内回公司上班，并提出如限期内不上班的处理措施。当员工擅自离职达到可以辞退的标准的时侯，用人单位应当将解除劳动关系的事宜公开，并以书面形式送达离职通知书给员工，通知其前来办理交接工作以及离职手续。至于通知书的送达，用人单位应采取挂号信或邮件形式，将通知书送达至员工信息登记的住址以及身份证地址或者经济联系人地址，并保存好回执。送达日期以签收日期为标准。若员工不签收，或邮寄信被退回，用人单位应当完好保留邮寄信，如有争议发生，至开庭时方才当仲裁员的面打开邮寄信，以证明用人单位履行了通知义务和用人单位解除劳动合同的意愿。必要时，用人单位可以在报纸上登声明，自通告之日起满三十天视为送达。另外，如果员工违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制的，造成用人单位损失的，用人单位可以申请仲裁，要求员工赔偿损失。如果用人单位为员工支付了培训费用，而员工未到期离开的，用人单位可以要求劳动者赔偿培训费。如果员工未与公司办理离职手续就到其它公司上班，造成原公司损失的，有实际数字证据，公司可以要求员工赔偿损失。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》第三十一条 劳动者解除劳动合同，应当提前三十日以书面形式通知用人单位。