跨境电商注册公司和注册个体商户的区别在于优惠政策不同、税务方面不同、税率不同、法律形式不同、投资主体不同。1、个体户不享受到优惠政策，没有投资风险。2、在税务方面。个体户不可以做进出口业务。3、税率方面。只有申请小规模纳税人。
跨境电商注册公司和注册个体商户的区别：
1、个体户不享受到优惠政策，没有投资风险。
2、在税务方面。个体户不可以做进出口业务。
3、税率方面。只有申请小规模纳税人。
4、法律形式不同。一人有限责任公司属于法定的民事主体，具有法人资格；而个人户不具有法人资格。
5、投资主体不同。一人有限责任公司的投资主体可以是自然人，也可以是法人；个人户的投资主体只能是自然人。
二、做跨境电商需要什么营业执照呢？
①营业执照分两种，一种是个体户营业执照，一种是公司营业执照。跨境电商营业执照可以注册个体户营业执照或者公司营业执照。
②每个平台有不同差异，如虾皮跨境只需要个体户营业执照即可，如果是亚马逊就需要公司类型营业执照。
③建议大家一定要注册公司的营业执照：
一是因为公司的营业执照去申请亚马逊的话会更容易通过；
二是因为亚马逊的门槛会越来越高。为了长远起见，建议大家一定要去注册一个有限责任公司的营业执照，而且，亚马逊欧洲站点是不接受个体户营业执照的。