近年来，质粒DNA疫苗在预防和治疗人类及动物疾病方面展现了广阔的研究前景。人们期待它能够对抗微生物感染性疾病和寄生虫病等疾病，同时也在基因水平上探讨其在肿瘤、遗传病和其他疾病治疗中的潜力。科学家们不断尝试利用核酸疫苗来实现这一目标。
针对非病毒微生物感染，核酸疫苗的免疫策略基于非病毒微生物蛋白在宿主细胞内的表达。尽管实验显示，注射编码非病毒微生物蛋白的核酸疫苗可以引发免疫反应，保护动物免受感染，如防治结核病、肺炎球菌感染等，但目前预防效果仍有待优化。寄生虫病防治方面，寄生虫的抗药性和疫苗难题仍然是挑战，但核酸疫苗为抗寄生虫感染带来了新希望。已有研究针对疟原虫、利氏曼原虫等开展，取得了一定进展。
在肿瘤领域，DNA疫苗作为新型治疗手段，尤其在治疗方面表现出潜力。它可以通过激发免疫系统杀死致癌病毒、识别并消除癌细胞，甚至通过转导和表达基因工程蛋白，增强癌细胞的免疫靶性。将编码肿瘤相关抗原的基因引入肿瘤细胞，能提高免疫原性，从而增强宿主对抗肿瘤的免疫反应。
核酸疫苗是将编码某种抗原蛋白的外源基因(DNA 或RNA ) 直接导入动物体细胞内, 并通过宿主细胞的表达系统合成抗原蛋白, 诱导宿主产生对该抗原蛋白的免疫应答, 以达到预防和治疗疾病的目的。