我国国际物流系统面临的主要问题是海运能力的不足，航线分布不均和港口数量有限。作为出口货物的主要运输方式，尽管我国海运运载能力达到近2000万吨，排名世界第八，但仍难以满足国际贸易的快速增长。过去曾出现过严重的缺船现象，且船型结构不合理，难以满足小批量、快速需求。港口布局的问题也突出，许多出口货物需要经香港中转，增加了运费和时间成本，影响了我国出口商品的竞争力。
铁路运输方面，尽管与周边国家如朝鲜、蒙古等有连接，但运力仍然捉襟见肘，尤其是对于供应香港港口的部分货物，铁路运输占了很大比例。内陆省份的出口货物，由于铁路运力不足，即使有市场需求也无法得到有效输送。
航空运输力的不足也是挑战，尽管空运在国际贸易中越来越普遍，但我国航空货运的发展相对落后。主要依赖客运飞机的捎带服务，货运飞机数量少，年运量仅20万吨，无法满足外贸快速发展的需求。
综上所述，为解决外贸出口运输的困境，国家和地方应共同努力，发展船队，加快沿海码头建设，并促进航空业的繁荣，以适应外贸发展的需求。
国际物流系统（International Logistic System），是由商品的包装、储存、运输、检验、流通加工和其前后的整理、再包装以及国际配送等子系统组成。其中，储存和运输子系统是物流的两大支柱。国际物流通过商品的储存和运输，实现其自身的时间和空间效益，满足国际贸易活动和跨国公司经营的要求。