影片一共六个故事，这和电影里的云图六重奏(Cloud Atlas Sextet)前后呼应。故事用带有宗教色彩的中心线和一些诸如时间、来世、因果、贪婪、统治、正义等元素拼凑起来，构成了这部好莱坞大片。简单分析如下：
故事1.
主要人物：
亚当 尤因---律师
奥图瓦
亨利医生
1849年亚当
尤因 （Adam Wing）签署了一份奴隶贩卖的合同。他在船上写出了《太平洋日记》，记录的事他从太平洋小岛旧金山的旅程。
医生亨利欺骗亚当说他患上了波利尼西亚虫病，为的骗取他的金币。
亚当救了黑奴奥图瓦，后来奥图瓦救了亚当，亚当回家后和妻子致力于黑奴解放运动。
亚当写的《太平洋日记》，就是罗伯特后来看的那本没写完的书。
故事2
人物：
路易莎雷伊（哈利贝瑞）
西克史密斯（老年）
胡克斯的工程师（汤姆汉克斯）
哈维斯戈麦耶
1973年路易莎雷伊（哈利贝瑞）调查西克史密斯博士死因
天鹅颈岛九头蛇反应堆—胡克斯杀死西克史密斯博士，为了掩盖核电站的缺陷制造大规模灾难和死亡，以保护自己的石油利益。
路易莎雷伊记者在电梯间碰巧碰到了西克史密斯，后来史密斯找路易莎想告诉她胡克斯的阴谋，却被胡克斯暗杀。后来路易莎致力于调查史密斯博士的死因。在调查过程中碰到了胡克斯公司的一位工程师（汤姆汉克斯,后来被发现说出了秘密，在飞机上被放上了炸药包，死翘翘了）路易莎在朋友帮助下战胜了胡克斯的集团。
路易莎发现了史密斯博士和罗伯特的来往信件，后来送给了希克斯的侄女。她在查找罗伯特的云图六重奏的时候感觉似曾相识。
哈维斯戈麦耶—小孩子，后来写了半衰期-路易莎雷伊之迷，投稿给蒂莫西（蒂莫西的逃亡之旅）
故事3
1937年剑桥
人物：
罗伯特弗洛比舍
西克史密斯
维维安 埃尔斯
埃尔斯夫人—伊俄卡斯特（哈利贝瑞）
罗伯特弗洛比舍 作曲家
作品：云图六重奏、永恒的轮回
罗伯特和西克史密斯是基友，罗伯特因为无法继承父亲的遗产，去投奔了维维安，成就自己的音乐梦想。罗伯特后来经常看的一本书就是亚当尤因的《太平洋日记。》
维维安-作曲家，老了之后因病无法进行创作，请罗伯特为他记录。罗伯特在他的灵感基础上创作了云图，和维维安老头子的夫人有染，后来竟然也想和维维安发生点什么。（灰常滴恶心）老头子维维安有次说自己梦中听见一段音乐，音乐的场所的人们有同一张脸，这个和故事5有关系。
故事4 蒂莫西的逃亡之旅The Ghastly Ordeal of
Timothy Cavendish
2012年伦敦
人物和名词：
德莫特霍金斯（汤姆汉克斯）是一位作者，作品 “饱以老拳“ （Knuckle Sandwich）
蒂莫西 卡文迪什 出版商
德尼—蒂莫西的哥哥
菲利克斯芬奇
霍金斯在伦敦的一次酒会上把一位讽刺他作品的评论家菲利克斯芬奇从高楼扔下摔死，而使自己名声大噪，卖不出去的书也成了畅销书。蒂莫西因此名利双收。可是不巧被无赖纠缠索财，为了5万英镑而欺骗和流浪。最后被他的哥哥送到了曙光之家（类似养老院），开始了种种越狱方案，最终和鹦鹉等四个人成功越狱。并且后来和自己年轻的恋人又走到了一起。 蒂莫西在火车上回忆的时候，看的一本稿子，就是哈维斯戈麦耶后来写出的《半衰期-路易莎雷伊之迷》
故事5 联盟解救星美反抗统治者
2144 新首尔
人物或名词：
PAPASONG
星美451
幼鹅939
复制人
李监管
张海柱
星美（SANMI）451就是故事6中山谷人崇拜的神。她本来是复制人，被联盟反抗组织的张海柱解救并开发，想要用她的真实经历对地球外殖民地发出地球复制人和被统治的真相，后来联盟行动失败，星美也被处死。但是她却成了山谷人的神。这个故事发生在2144年，那说明后来山谷人的故事应该还在2144年后的几百年之后发生。星美和张海柱在故事1中是一对夫妻。
故事6 山谷人、科纳人、先知人
人物或名词：
山谷人
先知人
科纳人
老乔吉
梅里尼姆（哈里贝瑞）
扎克里 贝瑞（汤姆汉克斯）
休格兰特（科纳人首领）
扎克里妹妹
凯特金 （扎克里妹妹的孩子）
夏威夷大岛，人类衰落后的106个冬天
故事5事件之后，人类经过几百年衰落了，地球上只有山谷人和科纳人。科纳人残忍野蛮，杀害了不少山谷人。山谷人过着近乎原始的生活。
先知人经常来到山谷，为了寻找灵魂山，目的是来到山上一个装置内，向地球的其他殖民地居民发出求救信号，因为他们感染了一种病，只剩下5个人。
梅里尼姆救了扎克里的妹妹的孩子，作为报答，扎克里带梅里尼姆来到了灵魂山，成功发射了求助信号。梅里尼姆也向扎克里解释了星美的真正背景。后来，扎克里的妹妹也被科纳人杀死，扎克里带着他妹妹的孩子跟随梅里尼姆一起逃亡到了梅里尼姆居住的地外星球。
老乔吉---经常以一个黑衣人的面目出现并且经常在扎克里耳边说话。他其实被比喻为人类内心深处的恶魔或阴暗面，在我们软弱和怀疑的时候，我们内心的阴暗面就会战胜我们的理智、信心和坚强。
整个电影的开头就是以扎克里老年的口吻来叙述的。扎克里在山谷中生活的时候，在一次睡觉中曾经梦见了所有云图的六个故事的某些细节。并为此向祭司占卜寻求答案。
梅里尼姆对山谷人崇拜的神---星美的解释，多少让人感觉有点嘲讽的味道。
以下三段话，是影片里面经常重复和有点睛之笔的话语：
1.“我绝不会向暴力犯罪屈服”
2. 我们的生命不是我们自己，从子宫到坟墓，我们和其他人紧紧相连
无论前世还是今生，每一桩恶行，每一项善举，都会决定我们未来的重生。
3. 那些经常改造时间和空间的力量，那些能够决定和改变我们设想好的命运的力量，在我们诞生前很久就起作用了，而且能够在我们死亡后继续起作用，我们的生命和我们的选择，就像量子轨迹，只有理解了这一刻，才能理解下一刻。在每一个交叉点上，每一次遭遇，都蕴含了一个新的或者潜在的方向。
这几句话，其实也就是这部电影的灵魂所在。
（其实还有一句话也是经典，就是罗伯特对西克史密斯说的那些话，关于打破和重建的，没有记录下来）。
还一个元素是彗星胎记。具体不知道代表什么，代表人生的转瞬即逝，还是轮回的标志，还是某个问题的答案的标志？
这部电影的核心意思就是轮回，来生，你所做的恶事和善事都成为你未来生命的发展方向，也影响了未来世界的发展。人与人相互联系，世间众多因素的相互碰撞才有了每个人的轨迹。
只是它用一种比较特别的方式来表达这样一个观点。除了核心含义外，还谈到了人类，科技，信仰，统治者和被统治者，贪婪，邪恶与正义、反抗、宗教等等。导演对这些主题通过电影表达出了自己的思想。这些大家在看电影的时候可以自己体会。之所以很多人觉得乱不好理解，是因为核心的几个演员在六个不同的故事里分别扮演不同的角色，六个故事都是这几个演员在演出，所以显得有点纷扰。观看的时候，抛开这些，也就没影响了。不过不同故事的同一演员扮演的不同人物的命运也有联系。故事的中心线和这些因素交织在一起，构成了这个故事。这部电影其实就是一个故事，只是导演把这个故事中的某个小细节展开，变成一个完整的故事，用轮回来生这样的主题将他们贯穿起来
追问片中有一些隐藏的线索. 比如说彗星胎记.是西克史密斯他基友和那个女的都有么？张海柱是复制人么？如果不是 在天桥上不是就摔死了么 是的话 为什么还要另一个有思想的复制人？这六个故事不是发生在同一个历史吧.祭祀告诉扎克里的话都应验了么？怎么看上去只有(残破的桥 躲在下面，手在流血 不要松开 敌人在背后 不要割喉这三句应验了.第四句呢？)